Protein–RNA interactions for Protein: P46094

XCR1, Chemokine XC receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCR1P46094 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
XCR1P46094 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
XCR1P46094 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
XCR1P46094 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
XCR1P46094 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
XCR1P46094 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
XCR1P46094 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
XCR1P46094 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
XCR1P46094 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
XCR1P46094 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
XCR1P46094 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
XCR1P46094 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
XCR1P46094 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
XCR1P46094 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
XCR1P46094 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
XCR1P46094 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
XCR1P46094 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
XCR1P46094 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
XCR1P46094 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
XCR1P46094 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
XCR1P46094 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
XCR1P46094 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
XCR1P46094 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
XCR1P46094 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
XCR1P46094 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
XCR1P46094 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
XCR1P46094 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
XCR1P46094 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
XCR1P46094 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
XCR1P46094 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
XCR1P46094 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
XCR1P46094 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
XCR1P46094 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
XCR1P46094 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
XCR1P46094 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
XCR1P46094 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
XCR1P46094 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
XCR1P46094 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
XCR1P46094 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
XCR1P46094 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
XCR1P46094 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
XCR1P46094 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
XCR1P46094 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
XCR1P46094 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
XCR1P46094 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
XCR1P46094 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
XCR1P46094 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
XCR1P46094 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
XCR1P46094 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
XCR1P46094 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
XCR1P46094 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
XCR1P46094 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
XCR1P46094 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
XCR1P46094 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
XCR1P46094 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
XCR1P46094 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
XCR1P46094 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
XCR1P46094 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
XCR1P46094 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
XCR1P46094 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
XCR1P46094 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
XCR1P46094 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
XCR1P46094 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
XCR1P46094 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
XCR1P46094 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
XCR1P46094 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
XCR1P46094 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
XCR1P46094 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
XCR1P46094 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
XCR1P46094 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
XCR1P46094 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
XCR1P46094 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
XCR1P46094 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
XCR1P46094 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
XCR1P46094 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
XCR1P46094 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
XCR1P46094 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
XCR1P46094 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
XCR1P46094 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
XCR1P46094 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
XCR1P46094 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
XCR1P46094 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
XCR1P46094 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
XCR1P46094 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
XCR1P46094 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
XCR1P46094 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
XCR1P46094 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
XCR1P46094 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
XCR1P46094 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
XCR1P46094 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
XCR1P46094 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
XCR1P46094 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
XCR1P46094 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
XCR1P46094 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
XCR1P46094 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
XCR1P46094 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
XCR1P46094 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
XCR1P46094 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
XCR1P46094 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
XCR1P46094 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms