Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MCAMP43121 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MCAMP43121 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MCAMP43121 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MCAMP43121 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MCAMP43121 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MCAMP43121 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MCAMP43121 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MCAMP43121 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MCAMP43121 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MCAMP43121 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
MCAMP43121 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
MCAMP43121 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MCAMP43121 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MCAMP43121 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MCAMP43121 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
MCAMP43121 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MCAMP43121 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
MCAMP43121 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MCAMP43121 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MCAMP43121 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MCAMP43121 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
MCAMP43121 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MCAMP43121 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MCAMP43121 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MCAMP43121 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MCAMP43121 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MCAMP43121 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCAMP43121 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCAMP43121 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCAMP43121 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
MCAMP43121 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCAMP43121 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCAMP43121 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCAMP43121 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCAMP43121 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
MCAMP43121 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCAMP43121 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCAMP43121 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCAMP43121 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCAMP43121 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
MCAMP43121 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCAMP43121 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCAMP43121 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCAMP43121 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCAMP43121 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCAMP43121 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCAMP43121 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCAMP43121 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCAMP43121 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCAMP43121 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCAMP43121 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCAMP43121 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCAMP43121 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCAMP43121 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCAMP43121 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCAMP43121 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCAMP43121 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCAMP43121 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCAMP43121 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCAMP43121 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCAMP43121 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCAMP43121 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
MCAMP43121 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
MCAMP43121 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCAMP43121 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCAMP43121 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCAMP43121 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCAMP43121 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
MCAMP43121 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCAMP43121 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCAMP43121 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCAMP43121 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCAMP43121 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCAMP43121 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCAMP43121 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCAMP43121 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCAMP43121 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCAMP43121 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCAMP43121 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCAMP43121 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MCAMP43121 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MCAMP43121 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MCAMP43121 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MCAMP43121 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MCAMP43121 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MCAMP43121 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MCAMP43121 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MCAMP43121 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MCAMP43121 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MCAMP43121 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MCAMP43121 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MCAMP43121 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MCAMP43121 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MCAMP43121 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MCAMP43121 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MCAMP43121 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCAMP43121 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCAMP43121 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCAMP43121 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms