Protein–RNA interactions for Protein: P38117

ETFB, Electron transfer flavoprotein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFBP38117 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ETFBP38117 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ETFBP38117 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ETFBP38117 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ETFBP38117 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ETFBP38117 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ETFBP38117 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ETFBP38117 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ETFBP38117 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ETFBP38117 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ETFBP38117 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ETFBP38117 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ETFBP38117 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ETFBP38117 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ETFBP38117 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ETFBP38117 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ETFBP38117 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ETFBP38117 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ETFBP38117 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ETFBP38117 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ETFBP38117 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ETFBP38117 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ETFBP38117 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ETFBP38117 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ETFBP38117 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ETFBP38117 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ETFBP38117 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ETFBP38117 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ETFBP38117 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ETFBP38117 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ETFBP38117 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ETFBP38117 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ETFBP38117 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ETFBP38117 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ETFBP38117 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ETFBP38117 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ETFBP38117 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ETFBP38117 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ETFBP38117 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ETFBP38117 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ETFBP38117 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ETFBP38117 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ETFBP38117 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ETFBP38117 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ETFBP38117 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ETFBP38117 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ETFBP38117 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ETFBP38117 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ETFBP38117 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ETFBP38117 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ETFBP38117 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ETFBP38117 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ETFBP38117 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ETFBP38117 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ETFBP38117 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ETFBP38117 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ETFBP38117 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ETFBP38117 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ETFBP38117 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ETFBP38117 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ETFBP38117 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ETFBP38117 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ETFBP38117 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ETFBP38117 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ETFBP38117 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ETFBP38117 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ETFBP38117 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ETFBP38117 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ETFBP38117 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ETFBP38117 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ETFBP38117 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ETFBP38117 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ETFBP38117 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ETFBP38117 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ETFBP38117 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ETFBP38117 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ETFBP38117 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ETFBP38117 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ETFBP38117 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ETFBP38117 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ETFBP38117 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ETFBP38117 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ETFBP38117 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ETFBP38117 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ETFBP38117 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ETFBP38117 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ETFBP38117 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ETFBP38117 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ETFBP38117 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ETFBP38117 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ETFBP38117 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ETFBP38117 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ETFBP38117 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ETFBP38117 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ETFBP38117 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ETFBP38117 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ETFBP38117 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ETFBP38117 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ETFBP38117 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ETFBP38117 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms