Protein–RNA interactions for Protein: P36543

ATP6V1E1, V-type proton ATPase subunit E 1, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1E1P36543 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP6V1E1P36543 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP6V1E1P36543 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP6V1E1P36543 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP6V1E1P36543 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP6V1E1P36543 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP6V1E1P36543 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP6V1E1P36543 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP6V1E1P36543 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP6V1E1P36543 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP6V1E1P36543 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP6V1E1P36543 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP6V1E1P36543 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP6V1E1P36543 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP6V1E1P36543 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP6V1E1P36543 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP6V1E1P36543 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP6V1E1P36543 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP6V1E1P36543 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP6V1E1P36543 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP6V1E1P36543 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP6V1E1P36543 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP6V1E1P36543 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP6V1E1P36543 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP6V1E1P36543 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP6V1E1P36543 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP6V1E1P36543 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP6V1E1P36543 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP6V1E1P36543 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP6V1E1P36543 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP6V1E1P36543 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP6V1E1P36543 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP6V1E1P36543 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP6V1E1P36543 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP6V1E1P36543 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP6V1E1P36543 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP6V1E1P36543 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP6V1E1P36543 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP6V1E1P36543 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP6V1E1P36543 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP6V1E1P36543 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP6V1E1P36543 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP6V1E1P36543 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP6V1E1P36543 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP6V1E1P36543 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP6V1E1P36543 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP6V1E1P36543 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP6V1E1P36543 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP6V1E1P36543 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP6V1E1P36543 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP6V1E1P36543 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP6V1E1P36543 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP6V1E1P36543 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP6V1E1P36543 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP6V1E1P36543 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP6V1E1P36543 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP6V1E1P36543 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP6V1E1P36543 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP6V1E1P36543 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP6V1E1P36543 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP6V1E1P36543 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP6V1E1P36543 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP6V1E1P36543 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP6V1E1P36543 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP6V1E1P36543 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP6V1E1P36543 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP6V1E1P36543 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP6V1E1P36543 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP6V1E1P36543 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP6V1E1P36543 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP6V1E1P36543 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP6V1E1P36543 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP6V1E1P36543 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP6V1E1P36543 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP6V1E1P36543 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP6V1E1P36543 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP6V1E1P36543 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP6V1E1P36543 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP6V1E1P36543 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP6V1E1P36543 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP6V1E1P36543 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms