Protein–RNA interactions for Protein: P31327

CPS1, Carbamoyl-phosphate synthase [ammonia], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1P31327 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CPS1P31327 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CPS1P31327 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CPS1P31327 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CPS1P31327 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CPS1P31327 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CPS1P31327 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CPS1P31327 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CPS1P31327 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CPS1P31327 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CPS1P31327 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CPS1P31327 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CPS1P31327 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CPS1P31327 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CPS1P31327 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CPS1P31327 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CPS1P31327 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CPS1P31327 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CPS1P31327 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CPS1P31327 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CPS1P31327 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CPS1P31327 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CPS1P31327 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CPS1P31327 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CPS1P31327 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CPS1P31327 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CPS1P31327 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CPS1P31327 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CPS1P31327 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CPS1P31327 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CPS1P31327 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CPS1P31327 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CPS1P31327 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CPS1P31327 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CPS1P31327 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CPS1P31327 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CPS1P31327 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CPS1P31327 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CPS1P31327 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CPS1P31327 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CPS1P31327 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CPS1P31327 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CPS1P31327 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
CPS1P31327 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CPS1P31327 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CPS1P31327 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CPS1P31327 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CPS1P31327 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CPS1P31327 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CPS1P31327 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
CPS1P31327 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CPS1P31327 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CPS1P31327 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CPS1P31327 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
CPS1P31327 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CPS1P31327 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
CPS1P31327 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CPS1P31327 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
CPS1P31327 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CPS1P31327 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CPS1P31327 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CPS1P31327 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CPS1P31327 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CPS1P31327 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CPS1P31327 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CPS1P31327 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CPS1P31327 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CPS1P31327 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CPS1P31327 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CPS1P31327 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CPS1P31327 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CPS1P31327 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CPS1P31327 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CPS1P31327 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CPS1P31327 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CPS1P31327 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CPS1P31327 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CPS1P31327 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CPS1P31327 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CPS1P31327 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CPS1P31327 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CPS1P31327 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CPS1P31327 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CPS1P31327 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CPS1P31327 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CPS1P31327 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CPS1P31327 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CPS1P31327 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CPS1P31327 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CPS1P31327 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CPS1P31327 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CPS1P31327 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CPS1P31327 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CPS1P31327 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CPS1P31327 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CPS1P31327 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CPS1P31327 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CPS1P31327 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CPS1P31327 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CPS1P31327 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms