Protein–RNA interactions for Protein: P30511

HLA-F, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain F, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-FP30511 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HLA-FP30511 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HLA-FP30511 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HLA-FP30511 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HLA-FP30511 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HLA-FP30511 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HLA-FP30511 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HLA-FP30511 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HLA-FP30511 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HLA-FP30511 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HLA-FP30511 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HLA-FP30511 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HLA-FP30511 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HLA-FP30511 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HLA-FP30511 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HLA-FP30511 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HLA-FP30511 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HLA-FP30511 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HLA-FP30511 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HLA-FP30511 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HLA-FP30511 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HLA-FP30511 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HLA-FP30511 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HLA-FP30511 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HLA-FP30511 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HLA-FP30511 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
HLA-FP30511 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HLA-FP30511 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HLA-FP30511 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HLA-FP30511 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HLA-FP30511 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-FP30511 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-FP30511 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-FP30511 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-FP30511 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-FP30511 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-FP30511 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-FP30511 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-FP30511 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-FP30511 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-FP30511 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-FP30511 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-FP30511 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-FP30511 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-FP30511 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-FP30511 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-FP30511 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-FP30511 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-FP30511 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-FP30511 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-FP30511 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-FP30511 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-FP30511 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-FP30511 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-FP30511 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-FP30511 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-FP30511 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-FP30511 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-FP30511 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-FP30511 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-FP30511 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-FP30511 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-FP30511 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-FP30511 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-FP30511 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-FP30511 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-FP30511 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-FP30511 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-FP30511 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-FP30511 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-FP30511 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-FP30511 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-FP30511 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-FP30511 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-FP30511 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-FP30511 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-FP30511 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-FP30511 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-FP30511 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-FP30511 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-FP30511 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-FP30511 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-FP30511 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-FP30511 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-FP30511 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-FP30511 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-FP30511 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-FP30511 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-FP30511 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-FP30511 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-FP30511 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-FP30511 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-FP30511 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-FP30511 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-FP30511 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-FP30511 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-FP30511 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-FP30511 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-FP30511 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-FP30511 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms