Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CNGA1P29973 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CNGA1P29973 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CNGA1P29973 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CNGA1P29973 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CNGA1P29973 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CNGA1P29973 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CNGA1P29973 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CNGA1P29973 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CNGA1P29973 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CNGA1P29973 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CNGA1P29973 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CNGA1P29973 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CNGA1P29973 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CNGA1P29973 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CNGA1P29973 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CNGA1P29973 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CNGA1P29973 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CNGA1P29973 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CNGA1P29973 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CNGA1P29973 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CNGA1P29973 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CNGA1P29973 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CNGA1P29973 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CNGA1P29973 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CNGA1P29973 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CNGA1P29973 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CNGA1P29973 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CNGA1P29973 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CNGA1P29973 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CNGA1P29973 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CNGA1P29973 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CNGA1P29973 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CNGA1P29973 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CNGA1P29973 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CNGA1P29973 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CNGA1P29973 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CNGA1P29973 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CNGA1P29973 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CNGA1P29973 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CNGA1P29973 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CNGA1P29973 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CNGA1P29973 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CNGA1P29973 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CNGA1P29973 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CNGA1P29973 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CNGA1P29973 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CNGA1P29973 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CNGA1P29973 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CNGA1P29973 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CNGA1P29973 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CNGA1P29973 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CNGA1P29973 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CNGA1P29973 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CNGA1P29973 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CNGA1P29973 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CNGA1P29973 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CNGA1P29973 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CNGA1P29973 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CNGA1P29973 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CNGA1P29973 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CNGA1P29973 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CNGA1P29973 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CNGA1P29973 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CNGA1P29973 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CNGA1P29973 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CNGA1P29973 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CNGA1P29973 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CNGA1P29973 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CNGA1P29973 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CNGA1P29973 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CNGA1P29973 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CNGA1P29973 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CNGA1P29973 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CNGA1P29973 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CNGA1P29973 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CNGA1P29973 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNGA1P29973 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNGA1P29973 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNGA1P29973 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNGA1P29973 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNGA1P29973 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNGA1P29973 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNGA1P29973 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNGA1P29973 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNGA1P29973 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNGA1P29973 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNGA1P29973 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNGA1P29973 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNGA1P29973 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNGA1P29973 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNGA1P29973 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNGA1P29973 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNGA1P29973 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CNGA1P29973 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNGA1P29973 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNGA1P29973 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNGA1P29973 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNGA1P29973 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNGA1P29973 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms