Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD40LGP29965 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD40LGP29965 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD40LGP29965 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD40LGP29965 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD40LGP29965 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CD40LGP29965 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD40LGP29965 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD40LGP29965 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD40LGP29965 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD40LGP29965 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD40LGP29965 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD40LGP29965 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD40LGP29965 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD40LGP29965 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD40LGP29965 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD40LGP29965 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD40LGP29965 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD40LGP29965 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD40LGP29965 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD40LGP29965 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CD40LGP29965 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD40LGP29965 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD40LGP29965 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD40LGP29965 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD40LGP29965 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD40LGP29965 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD40LGP29965 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD40LGP29965 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD40LGP29965 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD40LGP29965 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD40LGP29965 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD40LGP29965 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD40LGP29965 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD40LGP29965 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CD40LGP29965 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CD40LGP29965 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD40LGP29965 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD40LGP29965 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD40LGP29965 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD40LGP29965 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD40LGP29965 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD40LGP29965 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD40LGP29965 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD40LGP29965 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD40LGP29965 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD40LGP29965 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD40LGP29965 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD40LGP29965 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD40LGP29965 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD40LGP29965 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD40LGP29965 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD40LGP29965 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD40LGP29965 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD40LGP29965 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CD40LGP29965 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CD40LGP29965 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD40LGP29965 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD40LGP29965 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD40LGP29965 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD40LGP29965 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CD40LGP29965 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD40LGP29965 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD40LGP29965 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD40LGP29965 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD40LGP29965 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD40LGP29965 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD40LGP29965 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD40LGP29965 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD40LGP29965 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CD40LGP29965 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD40LGP29965 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD40LGP29965 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD40LGP29965 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD40LGP29965 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD40LGP29965 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD40LGP29965 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD40LGP29965 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD40LGP29965 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD40LGP29965 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD40LGP29965 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD40LGP29965 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD40LGP29965 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD40LGP29965 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD40LGP29965 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD40LGP29965 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD40LGP29965 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD40LGP29965 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CD40LGP29965 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD40LGP29965 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD40LGP29965 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD40LGP29965 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD40LGP29965 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD40LGP29965 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD40LGP29965 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD40LGP29965 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD40LGP29965 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD40LGP29965 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD40LGP29965 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms