Protein–RNA interactions for Protein: P29762

CRABP1, Cellular retinoic acid-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRABP1P29762 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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