Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GCAP28676 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GCAP28676 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GCAP28676 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GCAP28676 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GCAP28676 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GCAP28676 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GCAP28676 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GCAP28676 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GCAP28676 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GCAP28676 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GCAP28676 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GCAP28676 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GCAP28676 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GCAP28676 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GCAP28676 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GCAP28676 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GCAP28676 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GCAP28676 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GCAP28676 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GCAP28676 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GCAP28676 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GCAP28676 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GCAP28676 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GCAP28676 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GCAP28676 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GCAP28676 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GCAP28676 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GCAP28676 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GCAP28676 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GCAP28676 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GCAP28676 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GCAP28676 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GCAP28676 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GCAP28676 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GCAP28676 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GCAP28676 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GCAP28676 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GCAP28676 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GCAP28676 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GCAP28676 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GCAP28676 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GCAP28676 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GCAP28676 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GCAP28676 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GCAP28676 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GCAP28676 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GCAP28676 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GCAP28676 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GCAP28676 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GCAP28676 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GCAP28676 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GCAP28676 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GCAP28676 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GCAP28676 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GCAP28676 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GCAP28676 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GCAP28676 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GCAP28676 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GCAP28676 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GCAP28676 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GCAP28676 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GCAP28676 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GCAP28676 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GCAP28676 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GCAP28676 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GCAP28676 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GCAP28676 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GCAP28676 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GCAP28676 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GCAP28676 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GCAP28676 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GCAP28676 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GCAP28676 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GCAP28676 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GCAP28676 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GCAP28676 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GCAP28676 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GCAP28676 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GCAP28676 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GCAP28676 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GCAP28676 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GCAP28676 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GCAP28676 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GCAP28676 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GCAP28676 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GCAP28676 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GCAP28676 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GCAP28676 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GCAP28676 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GCAP28676 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
GCAP28676 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
GCAP28676 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GCAP28676 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GCAP28676 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
GCAP28676 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GCAP28676 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GCAP28676 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GCAP28676 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
GCAP28676 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms