Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DUSP1P28562 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUSP1P28562 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms