Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXD10P28358 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXD10P28358 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXD10P28358 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXD10P28358 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXD10P28358 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXD10P28358 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXD10P28358 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXD10P28358 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXD10P28358 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXD10P28358 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXD10P28358 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXD10P28358 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXD10P28358 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXD10P28358 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXD10P28358 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXD10P28358 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXD10P28358 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXD10P28358 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXD10P28358 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXD10P28358 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXD10P28358 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXD10P28358 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXD10P28358 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXD10P28358 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXD10P28358 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXD10P28358 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXD10P28358 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXD10P28358 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXD10P28358 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXD10P28358 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXD10P28358 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXD10P28358 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXD10P28358 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXD10P28358 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXD10P28358 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXD10P28358 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXD10P28358 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXD10P28358 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXD10P28358 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXD10P28358 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXD10P28358 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXD10P28358 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXD10P28358 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXD10P28358 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXD10P28358 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXD10P28358 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXD10P28358 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXD10P28358 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXD10P28358 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXD10P28358 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXD10P28358 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXD10P28358 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXD10P28358 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXD10P28358 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXD10P28358 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXD10P28358 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXD10P28358 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXD10P28358 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXD10P28358 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXD10P28358 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXD10P28358 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXD10P28358 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXD10P28358 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXD10P28358 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXD10P28358 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXD10P28358 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXD10P28358 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXD10P28358 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXD10P28358 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXD10P28358 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
HOXD10P28358 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms