Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PEX2P28328 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PEX2P28328 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PEX2P28328 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PEX2P28328 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PEX2P28328 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PEX2P28328 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PEX2P28328 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PEX2P28328 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PEX2P28328 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PEX2P28328 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PEX2P28328 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PEX2P28328 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PEX2P28328 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PEX2P28328 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PEX2P28328 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PEX2P28328 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PEX2P28328 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PEX2P28328 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PEX2P28328 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PEX2P28328 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PEX2P28328 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PEX2P28328 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PEX2P28328 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PEX2P28328 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PEX2P28328 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PEX2P28328 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PEX2P28328 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PEX2P28328 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PEX2P28328 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PEX2P28328 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PEX2P28328 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PEX2P28328 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PEX2P28328 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PEX2P28328 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PEX2P28328 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PEX2P28328 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PEX2P28328 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PEX2P28328 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PEX2P28328 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PEX2P28328 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PEX2P28328 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PEX2P28328 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PEX2P28328 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PEX2P28328 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PEX2P28328 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PEX2P28328 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PEX2P28328 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PEX2P28328 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PEX2P28328 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PEX2P28328 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PEX2P28328 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PEX2P28328 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PEX2P28328 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PEX2P28328 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PEX2P28328 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PEX2P28328 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PEX2P28328 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PEX2P28328 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PEX2P28328 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PEX2P28328 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PEX2P28328 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PEX2P28328 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PEX2P28328 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PEX2P28328 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PEX2P28328 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PEX2P28328 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PEX2P28328 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PEX2P28328 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PEX2P28328 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PEX2P28328 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PEX2P28328 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PEX2P28328 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PEX2P28328 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PEX2P28328 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PEX2P28328 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PEX2P28328 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PEX2P28328 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PEX2P28328 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PEX2P28328 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PEX2P28328 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PEX2P28328 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PEX2P28328 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PEX2P28328 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PEX2P28328 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PEX2P28328 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PEX2P28328 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PEX2P28328 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PEX2P28328 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PEX2P28328 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PEX2P28328 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PEX2P28328 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PEX2P28328 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PEX2P28328 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PEX2P28328 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PEX2P28328 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PEX2P28328 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PEX2P28328 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PEX2P28328 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PEX2P28328 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.7 ms