Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms