Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRAP18433 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRAP18433 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRAP18433 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRAP18433 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRAP18433 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRAP18433 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRAP18433 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRAP18433 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRAP18433 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRAP18433 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRAP18433 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRAP18433 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRAP18433 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRAP18433 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRAP18433 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRAP18433 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRAP18433 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRAP18433 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRAP18433 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRAP18433 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRAP18433 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRAP18433 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRAP18433 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRAP18433 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRAP18433 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRAP18433 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRAP18433 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRAP18433 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRAP18433 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRAP18433 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRAP18433 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRAP18433 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRAP18433 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRAP18433 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRAP18433 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRAP18433 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRAP18433 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRAP18433 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRAP18433 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
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PTPRAP18433 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRAP18433 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
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PTPRAP18433 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
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PTPRAP18433 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRAP18433 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRAP18433 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRAP18433 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
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PTPRAP18433 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPRAP18433 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
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PTPRAP18433 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPRAP18433 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPRAP18433 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPRAP18433 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPRAP18433 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
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PTPRAP18433 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPRAP18433 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPRAP18433 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPRAP18433 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPRAP18433 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPRAP18433 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPRAP18433 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRAP18433 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRAP18433 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRAP18433 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRAP18433 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRAP18433 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRAP18433 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRAP18433 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRAP18433 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRAP18433 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRAP18433 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRAP18433 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRAP18433 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRAP18433 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRAP18433 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRAP18433 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
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