Protein–RNA interactions for Protein: P15924

DSP, Desmoplakin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,871 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSPP15924 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DSPP15924 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DSPP15924 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DSPP15924 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DSPP15924 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DSPP15924 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DSPP15924 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DSPP15924 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DSPP15924 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
DSPP15924 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DSPP15924 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DSPP15924 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DSPP15924 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DSPP15924 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DSPP15924 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DSPP15924 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
DSPP15924 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DSPP15924 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DSPP15924 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DSPP15924 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DSPP15924 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DSPP15924 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DSPP15924 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
DSPP15924 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DSPP15924 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DSPP15924 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DSPP15924 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DSPP15924 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DSPP15924 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DSPP15924 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DSPP15924 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DSPP15924 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DSPP15924 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DSPP15924 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DSPP15924 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DSPP15924 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DSPP15924 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DSPP15924 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DSPP15924 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DSPP15924 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DSPP15924 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DSPP15924 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DSPP15924 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DSPP15924 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DSPP15924 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DSPP15924 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DSPP15924 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DSPP15924 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DSPP15924 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DSPP15924 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DSPP15924 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DSPP15924 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DSPP15924 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DSPP15924 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
DSPP15924 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
DSPP15924 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DSPP15924 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DSPP15924 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DSPP15924 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DSPP15924 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DSPP15924 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DSPP15924 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
DSPP15924 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DSPP15924 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DSPP15924 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
DSPP15924 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DSPP15924 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DSPP15924 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DSPP15924 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DSPP15924 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DSPP15924 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DSPP15924 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DSPP15924 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DSPP15924 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DSPP15924 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DSPP15924 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DSPP15924 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DSPP15924 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DSPP15924 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DSPP15924 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
DSPP15924 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DSPP15924 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
DSPP15924 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
DSPP15924 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DSPP15924 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DSPP15924 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DSPP15924 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DSPP15924 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DSPP15924 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DSPP15924 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
DSPP15924 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
DSPP15924 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
DSPP15924 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
DSPP15924 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
DSPP15924 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
DSPP15924 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
DSPP15924 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
DSPP15924 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
DSPP15924 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
DSPP15924 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms