Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ODC1P11926 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ODC1P11926 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ODC1P11926 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ODC1P11926 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ODC1P11926 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ODC1P11926 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ODC1P11926 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ODC1P11926 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ODC1P11926 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ODC1P11926 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ODC1P11926 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ODC1P11926 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ODC1P11926 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ODC1P11926 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ODC1P11926 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ODC1P11926 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ODC1P11926 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ODC1P11926 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ODC1P11926 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ODC1P11926 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ODC1P11926 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ODC1P11926 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ODC1P11926 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ODC1P11926 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ODC1P11926 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ODC1P11926 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ODC1P11926 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ODC1P11926 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ODC1P11926 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ODC1P11926 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ODC1P11926 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ODC1P11926 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ODC1P11926 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ODC1P11926 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ODC1P11926 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ODC1P11926 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ODC1P11926 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ODC1P11926 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ODC1P11926 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ODC1P11926 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ODC1P11926 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ODC1P11926 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ODC1P11926 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ODC1P11926 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ODC1P11926 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ODC1P11926 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ODC1P11926 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ODC1P11926 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ODC1P11926 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ODC1P11926 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ODC1P11926 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ODC1P11926 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ODC1P11926 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ODC1P11926 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ODC1P11926 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ODC1P11926 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ODC1P11926 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ODC1P11926 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ODC1P11926 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ODC1P11926 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ODC1P11926 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ODC1P11926 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ODC1P11926 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ODC1P11926 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ODC1P11926 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ODC1P11926 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ODC1P11926 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ODC1P11926 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ODC1P11926 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ODC1P11926 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ODC1P11926 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ODC1P11926 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ODC1P11926 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ODC1P11926 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ODC1P11926 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ODC1P11926 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ODC1P11926 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ODC1P11926 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
ODC1P11926 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ODC1P11926 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ODC1P11926 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ODC1P11926 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ODC1P11926 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ODC1P11926 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ODC1P11926 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ODC1P11926 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ODC1P11926 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ODC1P11926 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ODC1P11926 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ODC1P11926 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ODC1P11926 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ODC1P11926 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ODC1P11926 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ODC1P11926 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ODC1P11926 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ODC1P11926 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ODC1P11926 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ODC1P11926 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ODC1P11926 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.2 ms