Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD1

RGPD2, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD2P0DJD1 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RGPD2P0DJD1 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RGPD2P0DJD1 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RGPD2P0DJD1 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RGPD2P0DJD1 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RGPD2P0DJD1 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RGPD2P0DJD1 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RGPD2P0DJD1 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RGPD2P0DJD1 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RGPD2P0DJD1 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RGPD2P0DJD1 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RGPD2P0DJD1 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RGPD2P0DJD1 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RGPD2P0DJD1 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RGPD2P0DJD1 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RGPD2P0DJD1 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RGPD2P0DJD1 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RGPD2P0DJD1 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RGPD2P0DJD1 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RGPD2P0DJD1 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RGPD2P0DJD1 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RGPD2P0DJD1 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RGPD2P0DJD1 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RGPD2P0DJD1 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RGPD2P0DJD1 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RGPD2P0DJD1 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RGPD2P0DJD1 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RGPD2P0DJD1 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RGPD2P0DJD1 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RGPD2P0DJD1 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RGPD2P0DJD1 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RGPD2P0DJD1 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RGPD2P0DJD1 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RGPD2P0DJD1 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RGPD2P0DJD1 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RGPD2P0DJD1 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RGPD2P0DJD1 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RGPD2P0DJD1 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RGPD2P0DJD1 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RGPD2P0DJD1 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RGPD2P0DJD1 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RGPD2P0DJD1 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RGPD2P0DJD1 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RGPD2P0DJD1 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RGPD2P0DJD1 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RGPD2P0DJD1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RGPD2P0DJD1 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RGPD2P0DJD1 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RGPD2P0DJD1 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RGPD2P0DJD1 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RGPD2P0DJD1 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RGPD2P0DJD1 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RGPD2P0DJD1 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RGPD2P0DJD1 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RGPD2P0DJD1 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RGPD2P0DJD1 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RGPD2P0DJD1 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
RGPD2P0DJD1 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RGPD2P0DJD1 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RGPD2P0DJD1 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RGPD2P0DJD1 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RGPD2P0DJD1 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RGPD2P0DJD1 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RGPD2P0DJD1 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RGPD2P0DJD1 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RGPD2P0DJD1 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RGPD2P0DJD1 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RGPD2P0DJD1 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RGPD2P0DJD1 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RGPD2P0DJD1 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RGPD2P0DJD1 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RGPD2P0DJD1 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RGPD2P0DJD1 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RGPD2P0DJD1 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RGPD2P0DJD1 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RGPD2P0DJD1 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RGPD2P0DJD1 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RGPD2P0DJD1 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RGPD2P0DJD1 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RGPD2P0DJD1 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RGPD2P0DJD1 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RGPD2P0DJD1 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RGPD2P0DJD1 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RGPD2P0DJD1 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RGPD2P0DJD1 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RGPD2P0DJD1 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RGPD2P0DJD1 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RGPD2P0DJD1 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RGPD2P0DJD1 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RGPD2P0DJD1 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RGPD2P0DJD1 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RGPD2P0DJD1 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RGPD2P0DJD1 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RGPD2P0DJD1 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RGPD2P0DJD1 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RGPD2P0DJD1 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RGPD2P0DJD1 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RGPD2P0DJD1 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RGPD2P0DJD1 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RGPD2P0DJD1 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms