Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CENPBP07199 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CENPBP07199 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CENPBP07199 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CENPBP07199 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CENPBP07199 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CENPBP07199 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CENPBP07199 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CENPBP07199 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CENPBP07199 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CENPBP07199 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CENPBP07199 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CENPBP07199 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CENPBP07199 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CENPBP07199 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CENPBP07199 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CENPBP07199 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CENPBP07199 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CENPBP07199 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CENPBP07199 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CENPBP07199 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CENPBP07199 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CENPBP07199 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CENPBP07199 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CENPBP07199 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CENPBP07199 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CENPBP07199 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CENPBP07199 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CENPBP07199 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CENPBP07199 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CENPBP07199 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CENPBP07199 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CENPBP07199 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CENPBP07199 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CENPBP07199 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CENPBP07199 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CENPBP07199 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CENPBP07199 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CENPBP07199 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CENPBP07199 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CENPBP07199 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CENPBP07199 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CENPBP07199 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CENPBP07199 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CENPBP07199 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CENPBP07199 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CENPBP07199 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CENPBP07199 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CENPBP07199 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CENPBP07199 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CENPBP07199 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CENPBP07199 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CENPBP07199 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CENPBP07199 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CENPBP07199 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CENPBP07199 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CENPBP07199 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CENPBP07199 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CENPBP07199 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CENPBP07199 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CENPBP07199 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CENPBP07199 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CENPBP07199 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CENPBP07199 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CENPBP07199 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CENPBP07199 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CENPBP07199 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CENPBP07199 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CENPBP07199 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CENPBP07199 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CENPBP07199 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CENPBP07199 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CENPBP07199 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CENPBP07199 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CENPBP07199 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CENPBP07199 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CENPBP07199 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CENPBP07199 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CENPBP07199 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CENPBP07199 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CENPBP07199 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CENPBP07199 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CENPBP07199 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CENPBP07199 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CENPBP07199 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CENPBP07199 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CENPBP07199 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CENPBP07199 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CENPBP07199 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CENPBP07199 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CENPBP07199 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CENPBP07199 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CENPBP07199 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CENPBP07199 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CENPBP07199 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CENPBP07199 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CENPBP07199 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CENPBP07199 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CENPBP07199 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CENPBP07199 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms