Protein–RNA interactions for Protein: P06493

CDK1, Cyclin-dependent kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK1P06493 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK1P06493 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK1P06493 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK1P06493 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK1P06493 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK1P06493 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK1P06493 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK1P06493 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK1P06493 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK1P06493 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK1P06493 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK1P06493 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK1P06493 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK1P06493 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK1P06493 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK1P06493 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK1P06493 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK1P06493 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK1P06493 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK1P06493 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK1P06493 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK1P06493 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK1P06493 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK1P06493 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK1P06493 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK1P06493 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK1P06493 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK1P06493 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK1P06493 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK1P06493 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK1P06493 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK1P06493 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK1P06493 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK1P06493 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK1P06493 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK1P06493 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK1P06493 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK1P06493 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK1P06493 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK1P06493 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK1P06493 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK1P06493 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK1P06493 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK1P06493 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK1P06493 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK1P06493 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK1P06493 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK1P06493 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK1P06493 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK1P06493 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK1P06493 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK1P06493 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK1P06493 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK1P06493 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK1P06493 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK1P06493 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK1P06493 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK1P06493 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK1P06493 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK1P06493 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK1P06493 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK1P06493 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK1P06493 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK1P06493 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK1P06493 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK1P06493 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK1P06493 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK1P06493 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK1P06493 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK1P06493 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK1P06493 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK1P06493 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK1P06493 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK1P06493 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK1P06493 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK1P06493 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK1P06493 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK1P06493 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK1P06493 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK1P06493 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK1P06493 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK1P06493 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK1P06493 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK1P06493 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK1P06493 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK1P06493 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK1P06493 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDK1P06493 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDK1P06493 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDK1P06493 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDK1P06493 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDK1P06493 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDK1P06493 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDK1P06493 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDK1P06493 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CDK1P06493 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDK1P06493 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDK1P06493 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDK1P06493 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK1P06493 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms