Protein–RNA interactions for Protein: P01880

IGHD, Immunoglobulin heavy constant delta, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHDP01880 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IGHDP01880 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IGHDP01880 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IGHDP01880 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IGHDP01880 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IGHDP01880 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IGHDP01880 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IGHDP01880 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IGHDP01880 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IGHDP01880 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IGHDP01880 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
IGHDP01880 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IGHDP01880 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IGHDP01880 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IGHDP01880 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IGHDP01880 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
IGHDP01880 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IGHDP01880 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IGHDP01880 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IGHDP01880 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IGHDP01880 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IGHDP01880 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IGHDP01880 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IGHDP01880 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IGHDP01880 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IGHDP01880 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IGHDP01880 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IGHDP01880 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IGHDP01880 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IGHDP01880 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IGHDP01880 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IGHDP01880 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IGHDP01880 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IGHDP01880 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
IGHDP01880 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IGHDP01880 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IGHDP01880 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IGHDP01880 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IGHDP01880 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
IGHDP01880 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
IGHDP01880 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
IGHDP01880 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IGHDP01880 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IGHDP01880 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IGHDP01880 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IGHDP01880 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IGHDP01880 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IGHDP01880 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IGHDP01880 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IGHDP01880 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IGHDP01880 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IGHDP01880 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IGHDP01880 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IGHDP01880 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IGHDP01880 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IGHDP01880 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IGHDP01880 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IGHDP01880 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IGHDP01880 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IGHDP01880 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IGHDP01880 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IGHDP01880 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IGHDP01880 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IGHDP01880 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IGHDP01880 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
IGHDP01880 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IGHDP01880 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IGHDP01880 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IGHDP01880 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IGHDP01880 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
IGHDP01880 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IGHDP01880 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IGHDP01880 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IGHDP01880 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IGHDP01880 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IGHDP01880 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IGHDP01880 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IGHDP01880 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IGHDP01880 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IGHDP01880 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IGHDP01880 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IGHDP01880 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IGHDP01880 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IGHDP01880 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IGHDP01880 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IGHDP01880 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IGHDP01880 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IGHDP01880 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IGHDP01880 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IGHDP01880 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
IGHDP01880 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IGHDP01880 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
IGHDP01880 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IGHDP01880 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IGHDP01880 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
IGHDP01880 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IGHDP01880 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IGHDP01880 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IGHDP01880 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IGHDP01880 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms