Protein–RNA interactions for Protein: O96028

NSD2, Histone-lysine N-methyltransferase NSD2, humanhuman

Predictions only

Length 1,365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD2O96028 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NSD2O96028 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
NSD2O96028 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NSD2O96028 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NSD2O96028 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NSD2O96028 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NSD2O96028 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NSD2O96028 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NSD2O96028 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NSD2O96028 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
NSD2O96028 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
NSD2O96028 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NSD2O96028 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NSD2O96028 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NSD2O96028 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NSD2O96028 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NSD2O96028 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NSD2O96028 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NSD2O96028 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NSD2O96028 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NSD2O96028 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NSD2O96028 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
NSD2O96028 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NSD2O96028 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NSD2O96028 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NSD2O96028 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NSD2O96028 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NSD2O96028 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NSD2O96028 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NSD2O96028 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NSD2O96028 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NSD2O96028 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NSD2O96028 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NSD2O96028 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NSD2O96028 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NSD2O96028 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NSD2O96028 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NSD2O96028 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NSD2O96028 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NSD2O96028 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NSD2O96028 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NSD2O96028 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NSD2O96028 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NSD2O96028 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NSD2O96028 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
NSD2O96028 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NSD2O96028 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NSD2O96028 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
NSD2O96028 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NSD2O96028 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NSD2O96028 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
NSD2O96028 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NSD2O96028 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NSD2O96028 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NSD2O96028 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NSD2O96028 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NSD2O96028 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NSD2O96028 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NSD2O96028 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NSD2O96028 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NSD2O96028 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NSD2O96028 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NSD2O96028 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NSD2O96028 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NSD2O96028 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NSD2O96028 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NSD2O96028 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NSD2O96028 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NSD2O96028 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NSD2O96028 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NSD2O96028 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NSD2O96028 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NSD2O96028 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NSD2O96028 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NSD2O96028 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NSD2O96028 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
NSD2O96028 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NSD2O96028 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
NSD2O96028 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NSD2O96028 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NSD2O96028 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
NSD2O96028 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NSD2O96028 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NSD2O96028 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NSD2O96028 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NSD2O96028 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NSD2O96028 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NSD2O96028 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NSD2O96028 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NSD2O96028 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NSD2O96028 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NSD2O96028 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NSD2O96028 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NSD2O96028 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NSD2O96028 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NSD2O96028 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NSD2O96028 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NSD2O96028 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
NSD2O96028 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
NSD2O96028 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms