Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
POLR1AO95602 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
POLR1AO95602 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
POLR1AO95602 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
POLR1AO95602 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
POLR1AO95602 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
POLR1AO95602 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
POLR1AO95602 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
POLR1AO95602 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
POLR1AO95602 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
POLR1AO95602 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
POLR1AO95602 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
POLR1AO95602 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
POLR1AO95602 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
POLR1AO95602 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
POLR1AO95602 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
POLR1AO95602 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
POLR1AO95602 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
POLR1AO95602 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
POLR1AO95602 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
POLR1AO95602 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
POLR1AO95602 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
POLR1AO95602 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
POLR1AO95602 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
POLR1AO95602 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
POLR1AO95602 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
POLR1AO95602 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
POLR1AO95602 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
POLR1AO95602 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
POLR1AO95602 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
POLR1AO95602 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
POLR1AO95602 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
POLR1AO95602 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
POLR1AO95602 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
POLR1AO95602 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
POLR1AO95602 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
POLR1AO95602 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
POLR1AO95602 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
POLR1AO95602 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
POLR1AO95602 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
POLR1AO95602 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
POLR1AO95602 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
POLR1AO95602 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
POLR1AO95602 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
POLR1AO95602 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
POLR1AO95602 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
POLR1AO95602 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
POLR1AO95602 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
POLR1AO95602 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
POLR1AO95602 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
POLR1AO95602 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
POLR1AO95602 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
POLR1AO95602 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
POLR1AO95602 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
POLR1AO95602 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
POLR1AO95602 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
POLR1AO95602 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
POLR1AO95602 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
POLR1AO95602 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
POLR1AO95602 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
POLR1AO95602 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
POLR1AO95602 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
POLR1AO95602 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
POLR1AO95602 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
POLR1AO95602 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
POLR1AO95602 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
POLR1AO95602 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
POLR1AO95602 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
POLR1AO95602 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
POLR1AO95602 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
POLR1AO95602 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
POLR1AO95602 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
POLR1AO95602 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
POLR1AO95602 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
POLR1AO95602 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
POLR1AO95602 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
POLR1AO95602 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
POLR1AO95602 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
POLR1AO95602 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
POLR1AO95602 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
POLR1AO95602 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
POLR1AO95602 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
POLR1AO95602 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
POLR1AO95602 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
POLR1AO95602 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
POLR1AO95602 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
POLR1AO95602 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
POLR1AO95602 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
POLR1AO95602 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
POLR1AO95602 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
POLR1AO95602 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
POLR1AO95602 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
POLR1AO95602 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
POLR1AO95602 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
POLR1AO95602 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
POLR1AO95602 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
POLR1AO95602 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
POLR1AO95602 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
POLR1AO95602 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
POLR1AO95602 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.6 ms