Protein–RNA interactions for Protein: O95487

SEC24B, Protein transport protein Sec24B, humanhuman

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24BO95487 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEC24BO95487 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEC24BO95487 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEC24BO95487 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SEC24BO95487 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEC24BO95487 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEC24BO95487 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEC24BO95487 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEC24BO95487 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEC24BO95487 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEC24BO95487 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEC24BO95487 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEC24BO95487 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SEC24BO95487 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SEC24BO95487 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEC24BO95487 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEC24BO95487 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEC24BO95487 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEC24BO95487 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEC24BO95487 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEC24BO95487 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEC24BO95487 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEC24BO95487 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEC24BO95487 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEC24BO95487 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEC24BO95487 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEC24BO95487 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEC24BO95487 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEC24BO95487 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEC24BO95487 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEC24BO95487 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SEC24BO95487 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEC24BO95487 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEC24BO95487 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEC24BO95487 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEC24BO95487 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEC24BO95487 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEC24BO95487 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEC24BO95487 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEC24BO95487 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEC24BO95487 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEC24BO95487 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEC24BO95487 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEC24BO95487 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEC24BO95487 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEC24BO95487 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEC24BO95487 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEC24BO95487 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEC24BO95487 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEC24BO95487 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEC24BO95487 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEC24BO95487 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SEC24BO95487 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEC24BO95487 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEC24BO95487 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEC24BO95487 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEC24BO95487 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEC24BO95487 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEC24BO95487 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEC24BO95487 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SEC24BO95487 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SEC24BO95487 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
SEC24BO95487 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SEC24BO95487 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SEC24BO95487 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SEC24BO95487 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SEC24BO95487 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SEC24BO95487 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SEC24BO95487 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SEC24BO95487 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SEC24BO95487 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SEC24BO95487 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SEC24BO95487 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEC24BO95487 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEC24BO95487 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEC24BO95487 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEC24BO95487 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEC24BO95487 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEC24BO95487 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEC24BO95487 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEC24BO95487 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEC24BO95487 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEC24BO95487 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEC24BO95487 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEC24BO95487 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEC24BO95487 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SEC24BO95487 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SEC24BO95487 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SEC24BO95487 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEC24BO95487 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEC24BO95487 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEC24BO95487 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEC24BO95487 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SEC24BO95487 AP001002.2-201ENST00000625137 386 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SEC24BO95487 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SEC24BO95487 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEC24BO95487 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEC24BO95487 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEC24BO95487 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEC24BO95487 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms