Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
E2F6O75461 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
E2F6O75461 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
E2F6O75461 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
E2F6O75461 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
E2F6O75461 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
E2F6O75461 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
E2F6O75461 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
E2F6O75461 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
E2F6O75461 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
E2F6O75461 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
E2F6O75461 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
E2F6O75461 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
E2F6O75461 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
E2F6O75461 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
E2F6O75461 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
E2F6O75461 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
E2F6O75461 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
E2F6O75461 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
E2F6O75461 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
E2F6O75461 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
E2F6O75461 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
E2F6O75461 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
E2F6O75461 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
E2F6O75461 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
E2F6O75461 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
E2F6O75461 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
E2F6O75461 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
E2F6O75461 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
E2F6O75461 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
E2F6O75461 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
E2F6O75461 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
E2F6O75461 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
E2F6O75461 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
E2F6O75461 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
E2F6O75461 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
E2F6O75461 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
E2F6O75461 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
E2F6O75461 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
E2F6O75461 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
E2F6O75461 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
E2F6O75461 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
E2F6O75461 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
E2F6O75461 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
E2F6O75461 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
E2F6O75461 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
E2F6O75461 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
E2F6O75461 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
E2F6O75461 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
E2F6O75461 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
E2F6O75461 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
E2F6O75461 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
E2F6O75461 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
E2F6O75461 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
E2F6O75461 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
E2F6O75461 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
E2F6O75461 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
E2F6O75461 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
E2F6O75461 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
E2F6O75461 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
E2F6O75461 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
E2F6O75461 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
E2F6O75461 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
E2F6O75461 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
E2F6O75461 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
E2F6O75461 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
E2F6O75461 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
E2F6O75461 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
E2F6O75461 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
E2F6O75461 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
E2F6O75461 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
E2F6O75461 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
E2F6O75461 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
E2F6O75461 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
E2F6O75461 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
E2F6O75461 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
E2F6O75461 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
E2F6O75461 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
E2F6O75461 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
E2F6O75461 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
E2F6O75461 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
E2F6O75461 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
E2F6O75461 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
E2F6O75461 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
E2F6O75461 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
E2F6O75461 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
E2F6O75461 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
E2F6O75461 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
E2F6O75461 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
E2F6O75461 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
E2F6O75461 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
E2F6O75461 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
E2F6O75461 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
E2F6O75461 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
E2F6O75461 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
E2F6O75461 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
E2F6O75461 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
E2F6O75461 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
E2F6O75461 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
E2F6O75461 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms