Protein–RNA interactions for Protein: O75143

ATG13, Autophagy-related protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG13O75143 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATG13O75143 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATG13O75143 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATG13O75143 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ATG13O75143 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ATG13O75143 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ATG13O75143 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATG13O75143 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ATG13O75143 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATG13O75143 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATG13O75143 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATG13O75143 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATG13O75143 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATG13O75143 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATG13O75143 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATG13O75143 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATG13O75143 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATG13O75143 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATG13O75143 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATG13O75143 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATG13O75143 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATG13O75143 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATG13O75143 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATG13O75143 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATG13O75143 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATG13O75143 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATG13O75143 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATG13O75143 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ATG13O75143 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATG13O75143 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATG13O75143 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATG13O75143 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATG13O75143 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATG13O75143 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATG13O75143 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATG13O75143 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATG13O75143 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATG13O75143 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATG13O75143 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATG13O75143 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATG13O75143 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATG13O75143 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATG13O75143 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ATG13O75143 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATG13O75143 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATG13O75143 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATG13O75143 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATG13O75143 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATG13O75143 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATG13O75143 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATG13O75143 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATG13O75143 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATG13O75143 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATG13O75143 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATG13O75143 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATG13O75143 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATG13O75143 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATG13O75143 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATG13O75143 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ATG13O75143 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATG13O75143 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATG13O75143 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATG13O75143 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATG13O75143 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATG13O75143 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATG13O75143 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATG13O75143 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATG13O75143 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATG13O75143 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATG13O75143 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATG13O75143 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATG13O75143 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ATG13O75143 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATG13O75143 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATG13O75143 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATG13O75143 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATG13O75143 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATG13O75143 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATG13O75143 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATG13O75143 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATG13O75143 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATG13O75143 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATG13O75143 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATG13O75143 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATG13O75143 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATG13O75143 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATG13O75143 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ATG13O75143 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ATG13O75143 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATG13O75143 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATG13O75143 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATG13O75143 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATG13O75143 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATG13O75143 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATG13O75143 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATG13O75143 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATG13O75143 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATG13O75143 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATG13O75143 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATG13O75143 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms