Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPLO60437 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPLO60437 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPLO60437 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPLO60437 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPLO60437 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPLO60437 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPLO60437 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPLO60437 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPLO60437 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPLO60437 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPLO60437 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPLO60437 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPLO60437 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPLO60437 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPLO60437 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPLO60437 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPLO60437 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPLO60437 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPLO60437 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPLO60437 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPLO60437 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPLO60437 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PPLO60437 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPLO60437 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPLO60437 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PPLO60437 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PPLO60437 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPLO60437 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPLO60437 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPLO60437 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPLO60437 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPLO60437 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PPLO60437 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PPLO60437 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PPLO60437 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PPLO60437 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PPLO60437 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PPLO60437 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PPLO60437 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PPLO60437 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PPLO60437 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PPLO60437 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PPLO60437 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PPLO60437 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PPLO60437 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PPLO60437 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PPLO60437 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
PPLO60437 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PPLO60437 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PPLO60437 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
PPLO60437 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PPLO60437 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
PPLO60437 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPLO60437 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPLO60437 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPLO60437 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPLO60437 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPLO60437 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPLO60437 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPLO60437 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPLO60437 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPLO60437 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PPLO60437 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PPLO60437 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPLO60437 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPLO60437 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPLO60437 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PPLO60437 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPLO60437 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPLO60437 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPLO60437 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPLO60437 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPLO60437 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPLO60437 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPLO60437 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPLO60437 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPLO60437 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PPLO60437 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPLO60437 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PPLO60437 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PPLO60437 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PPLO60437 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PPLO60437 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PPLO60437 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PPLO60437 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PPLO60437 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PPLO60437 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PPLO60437 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PPLO60437 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PPLO60437 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PPLO60437 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PPLO60437 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PPLO60437 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PPLO60437 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PPLO60437 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PPLO60437 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PPLO60437 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PPLO60437 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PPLO60437 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms