Protein–RNA interactions for Protein: O43924

PDE6D, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit delta, humanhuman

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Length 150 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6DO43924 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PDE6DO43924 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PDE6DO43924 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PDE6DO43924 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PDE6DO43924 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PDE6DO43924 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PDE6DO43924 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PDE6DO43924 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
PDE6DO43924 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PDE6DO43924 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PDE6DO43924 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PDE6DO43924 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PDE6DO43924 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
PDE6DO43924 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PDE6DO43924 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PDE6DO43924 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PDE6DO43924 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
PDE6DO43924 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PDE6DO43924 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PDE6DO43924 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PDE6DO43924 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PDE6DO43924 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PDE6DO43924 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PDE6DO43924 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PDE6DO43924 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PDE6DO43924 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PDE6DO43924 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PDE6DO43924 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PDE6DO43924 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PDE6DO43924 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
PDE6DO43924 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PDE6DO43924 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PDE6DO43924 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PDE6DO43924 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PDE6DO43924 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PDE6DO43924 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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PDE6DO43924 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
PDE6DO43924 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PDE6DO43924 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PDE6DO43924 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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PDE6DO43924 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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PDE6DO43924 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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PDE6DO43924 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PDE6DO43924 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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PDE6DO43924 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PDE6DO43924 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
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PDE6DO43924 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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PDE6DO43924 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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PDE6DO43924 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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PDE6DO43924 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PDE6DO43924 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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PDE6DO43924 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PDE6DO43924 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
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PDE6DO43924 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PDE6DO43924 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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PDE6DO43924 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PDE6DO43924 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PDE6DO43924 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PDE6DO43924 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PDE6DO43924 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
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