Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP9BO43861 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms