Protein–RNA interactions for Protein: O43524

FOXO3, Forkhead box protein O3, humanhuman

Predictions only

Length 673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO3O43524 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOXO3O43524 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOXO3O43524 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOXO3O43524 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FOXO3O43524 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FOXO3O43524 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FOXO3O43524 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FOXO3O43524 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FOXO3O43524 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FOXO3O43524 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FOXO3O43524 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FOXO3O43524 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FOXO3O43524 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FOXO3O43524 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FOXO3O43524 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FOXO3O43524 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FOXO3O43524 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FOXO3O43524 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FOXO3O43524 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FOXO3O43524 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
FOXO3O43524 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
FOXO3O43524 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FOXO3O43524 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FOXO3O43524 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FOXO3O43524 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FOXO3O43524 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FOXO3O43524 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FOXO3O43524 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FOXO3O43524 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FOXO3O43524 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
FOXO3O43524 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FOXO3O43524 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FOXO3O43524 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FOXO3O43524 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
FOXO3O43524 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FOXO3O43524 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FOXO3O43524 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FOXO3O43524 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FOXO3O43524 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FOXO3O43524 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
FOXO3O43524 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FOXO3O43524 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
FOXO3O43524 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
FOXO3O43524 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FOXO3O43524 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FOXO3O43524 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FOXO3O43524 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FOXO3O43524 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FOXO3O43524 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FOXO3O43524 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FOXO3O43524 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FOXO3O43524 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FOXO3O43524 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FOXO3O43524 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FOXO3O43524 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FOXO3O43524 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FOXO3O43524 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FOXO3O43524 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FOXO3O43524 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FOXO3O43524 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FOXO3O43524 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FOXO3O43524 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FOXO3O43524 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
FOXO3O43524 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FOXO3O43524 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FOXO3O43524 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FOXO3O43524 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FOXO3O43524 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FOXO3O43524 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FOXO3O43524 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FOXO3O43524 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
FOXO3O43524 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
FOXO3O43524 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
FOXO3O43524 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOXO3O43524 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOXO3O43524 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOXO3O43524 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOXO3O43524 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
FOXO3O43524 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOXO3O43524 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOXO3O43524 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOXO3O43524 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOXO3O43524 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOXO3O43524 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOXO3O43524 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOXO3O43524 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOXO3O43524 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOXO3O43524 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOXO3O43524 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOXO3O43524 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
FOXO3O43524 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOXO3O43524 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOXO3O43524 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOXO3O43524 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOXO3O43524 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOXO3O43524 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOXO3O43524 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOXO3O43524 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOXO3O43524 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOXO3O43524 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms