Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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