Protein–RNA interactions for Protein: O14727

APAF1, Apoptotic protease-activating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APAF1O14727 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
APAF1O14727 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
APAF1O14727 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
APAF1O14727 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
APAF1O14727 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
APAF1O14727 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
APAF1O14727 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
APAF1O14727 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
APAF1O14727 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
APAF1O14727 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
APAF1O14727 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
APAF1O14727 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
APAF1O14727 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
APAF1O14727 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
APAF1O14727 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
APAF1O14727 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
APAF1O14727 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
APAF1O14727 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
APAF1O14727 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
APAF1O14727 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
APAF1O14727 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
APAF1O14727 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
APAF1O14727 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
APAF1O14727 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
APAF1O14727 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
APAF1O14727 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
APAF1O14727 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
APAF1O14727 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
APAF1O14727 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
APAF1O14727 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
APAF1O14727 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
APAF1O14727 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
APAF1O14727 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
APAF1O14727 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
APAF1O14727 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
APAF1O14727 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
APAF1O14727 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
APAF1O14727 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
APAF1O14727 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
APAF1O14727 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
APAF1O14727 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
APAF1O14727 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
APAF1O14727 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
APAF1O14727 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
APAF1O14727 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
APAF1O14727 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
APAF1O14727 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
APAF1O14727 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
APAF1O14727 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
APAF1O14727 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
APAF1O14727 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
APAF1O14727 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
APAF1O14727 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
APAF1O14727 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
APAF1O14727 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
APAF1O14727 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
APAF1O14727 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
APAF1O14727 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
APAF1O14727 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
APAF1O14727 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
APAF1O14727 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
APAF1O14727 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
APAF1O14727 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
APAF1O14727 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
APAF1O14727 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
APAF1O14727 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
APAF1O14727 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
APAF1O14727 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
APAF1O14727 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
APAF1O14727 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
APAF1O14727 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
APAF1O14727 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
APAF1O14727 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
APAF1O14727 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
APAF1O14727 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
APAF1O14727 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
APAF1O14727 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
APAF1O14727 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
APAF1O14727 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
APAF1O14727 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
APAF1O14727 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
APAF1O14727 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
APAF1O14727 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
APAF1O14727 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
APAF1O14727 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
APAF1O14727 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
APAF1O14727 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
APAF1O14727 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
APAF1O14727 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
APAF1O14727 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
APAF1O14727 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
APAF1O14727 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
APAF1O14727 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
APAF1O14727 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
APAF1O14727 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
APAF1O14727 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
APAF1O14727 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
APAF1O14727 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
APAF1O14727 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
APAF1O14727 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms