Protein–RNA interactions for Protein: O14595

CTDSP2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, humanhuman

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Length 271 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2O14595 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTDSP2O14595 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CTDSP2O14595 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTDSP2O14595 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTDSP2O14595 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTDSP2O14595 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTDSP2O14595 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTDSP2O14595 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTDSP2O14595 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTDSP2O14595 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTDSP2O14595 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTDSP2O14595 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTDSP2O14595 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTDSP2O14595 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTDSP2O14595 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTDSP2O14595 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTDSP2O14595 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTDSP2O14595 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTDSP2O14595 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTDSP2O14595 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTDSP2O14595 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTDSP2O14595 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTDSP2O14595 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTDSP2O14595 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTDSP2O14595 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTDSP2O14595 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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CTDSP2O14595 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTDSP2O14595 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTDSP2O14595 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTDSP2O14595 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTDSP2O14595 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTDSP2O14595 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTDSP2O14595 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTDSP2O14595 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTDSP2O14595 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTDSP2O14595 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTDSP2O14595 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTDSP2O14595 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTDSP2O14595 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTDSP2O14595 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTDSP2O14595 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTDSP2O14595 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTDSP2O14595 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTDSP2O14595 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTDSP2O14595 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTDSP2O14595 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTDSP2O14595 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTDSP2O14595 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CTDSP2O14595 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTDSP2O14595 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTDSP2O14595 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTDSP2O14595 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTDSP2O14595 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTDSP2O14595 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTDSP2O14595 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTDSP2O14595 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTDSP2O14595 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTDSP2O14595 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTDSP2O14595 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTDSP2O14595 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTDSP2O14595 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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CTDSP2O14595 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTDSP2O14595 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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CTDSP2O14595 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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CTDSP2O14595 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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CTDSP2O14595 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTDSP2O14595 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTDSP2O14595 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTDSP2O14595 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTDSP2O14595 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTDSP2O14595 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTDSP2O14595 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTDSP2O14595 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTDSP2O14595 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTDSP2O14595 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTDSP2O14595 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CTDSP2O14595 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTDSP2O14595 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTDSP2O14595 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTDSP2O14595 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTDSP2O14595 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTDSP2O14595 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTDSP2O14595 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTDSP2O14595 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTDSP2O14595 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CTDSP2O14595 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTDSP2O14595 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTDSP2O14595 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTDSP2O14595 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTDSP2O14595 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTDSP2O14595 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CTDSP2O14595 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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