Protein–RNA interactions for Protein: O00512

BCL9, B-cell CLL/lymphoma 9 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCL9O00512 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BCL9O00512 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BCL9O00512 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BCL9O00512 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BCL9O00512 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BCL9O00512 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BCL9O00512 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BCL9O00512 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BCL9O00512 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BCL9O00512 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BCL9O00512 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BCL9O00512 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BCL9O00512 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BCL9O00512 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BCL9O00512 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
BCL9O00512 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BCL9O00512 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BCL9O00512 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BCL9O00512 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BCL9O00512 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BCL9O00512 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BCL9O00512 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BCL9O00512 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BCL9O00512 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BCL9O00512 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
BCL9O00512 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BCL9O00512 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BCL9O00512 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BCL9O00512 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BCL9O00512 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BCL9O00512 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BCL9O00512 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BCL9O00512 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BCL9O00512 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BCL9O00512 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BCL9O00512 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BCL9O00512 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BCL9O00512 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BCL9O00512 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BCL9O00512 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BCL9O00512 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BCL9O00512 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BCL9O00512 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BCL9O00512 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
BCL9O00512 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BCL9O00512 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BCL9O00512 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BCL9O00512 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
BCL9O00512 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BCL9O00512 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BCL9O00512 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BCL9O00512 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BCL9O00512 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BCL9O00512 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BCL9O00512 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BCL9O00512 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BCL9O00512 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BCL9O00512 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BCL9O00512 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BCL9O00512 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BCL9O00512 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BCL9O00512 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BCL9O00512 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
BCL9O00512 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BCL9O00512 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BCL9O00512 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BCL9O00512 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BCL9O00512 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BCL9O00512 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BCL9O00512 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BCL9O00512 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BCL9O00512 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BCL9O00512 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BCL9O00512 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BCL9O00512 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BCL9O00512 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BCL9O00512 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BCL9O00512 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
BCL9O00512 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BCL9O00512 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BCL9O00512 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BCL9O00512 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BCL9O00512 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BCL9O00512 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BCL9O00512 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
BCL9O00512 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
BCL9O00512 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
BCL9O00512 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BCL9O00512 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BCL9O00512 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BCL9O00512 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BCL9O00512 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BCL9O00512 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BCL9O00512 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BCL9O00512 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BCL9O00512 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BCL9O00512 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BCL9O00512 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BCL9O00512 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BCL9O00512 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms