Protein–RNA interactions for Protein: O00472

ELL2, RNA polymerase II elongation factor ELL2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL2O00472 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ELL2O00472 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ELL2O00472 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ELL2O00472 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ELL2O00472 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ELL2O00472 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ELL2O00472 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ELL2O00472 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ELL2O00472 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ELL2O00472 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ELL2O00472 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ELL2O00472 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ELL2O00472 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ELL2O00472 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ELL2O00472 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ELL2O00472 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ELL2O00472 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ELL2O00472 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ELL2O00472 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ELL2O00472 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ELL2O00472 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ELL2O00472 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ELL2O00472 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ELL2O00472 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ELL2O00472 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ELL2O00472 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ELL2O00472 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ELL2O00472 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ELL2O00472 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ELL2O00472 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ELL2O00472 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ELL2O00472 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ELL2O00472 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ELL2O00472 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ELL2O00472 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ELL2O00472 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ELL2O00472 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ELL2O00472 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ELL2O00472 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ELL2O00472 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ELL2O00472 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ELL2O00472 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ELL2O00472 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ELL2O00472 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ELL2O00472 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ELL2O00472 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ELL2O00472 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ELL2O00472 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ELL2O00472 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ELL2O00472 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ELL2O00472 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ELL2O00472 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ELL2O00472 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ELL2O00472 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ELL2O00472 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ELL2O00472 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ELL2O00472 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ELL2O00472 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ELL2O00472 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ELL2O00472 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ELL2O00472 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ELL2O00472 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ELL2O00472 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ELL2O00472 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ELL2O00472 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ELL2O00472 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ELL2O00472 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ELL2O00472 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ELL2O00472 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ELL2O00472 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ELL2O00472 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ELL2O00472 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ELL2O00472 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ELL2O00472 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ELL2O00472 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ELL2O00472 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ELL2O00472 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ELL2O00472 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ELL2O00472 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ELL2O00472 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ELL2O00472 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ELL2O00472 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ELL2O00472 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ELL2O00472 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ELL2O00472 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ELL2O00472 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ELL2O00472 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ELL2O00472 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ELL2O00472 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ELL2O00472 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ELL2O00472 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ELL2O00472 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ELL2O00472 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ELL2O00472 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ELL2O00472 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ELL2O00472 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ELL2O00472 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ELL2O00472 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ELL2O00472 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ELL2O00472 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms