Protein–RNA interactions for Protein: O00161

SNAP23, Synaptosomal-associated protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP23O00161 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNAP23O00161 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNAP23O00161 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNAP23O00161 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNAP23O00161 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNAP23O00161 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNAP23O00161 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNAP23O00161 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNAP23O00161 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SNAP23O00161 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNAP23O00161 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNAP23O00161 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNAP23O00161 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNAP23O00161 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNAP23O00161 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNAP23O00161 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNAP23O00161 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNAP23O00161 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNAP23O00161 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNAP23O00161 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNAP23O00161 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNAP23O00161 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNAP23O00161 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNAP23O00161 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SNAP23O00161 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNAP23O00161 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNAP23O00161 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNAP23O00161 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNAP23O00161 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNAP23O00161 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNAP23O00161 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNAP23O00161 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNAP23O00161 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNAP23O00161 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNAP23O00161 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNAP23O00161 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNAP23O00161 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNAP23O00161 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNAP23O00161 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SNAP23O00161 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNAP23O00161 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNAP23O00161 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNAP23O00161 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNAP23O00161 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNAP23O00161 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNAP23O00161 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNAP23O00161 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNAP23O00161 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNAP23O00161 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNAP23O00161 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNAP23O00161 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNAP23O00161 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNAP23O00161 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNAP23O00161 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNAP23O00161 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNAP23O00161 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNAP23O00161 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SNAP23O00161 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNAP23O00161 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNAP23O00161 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNAP23O00161 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNAP23O00161 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNAP23O00161 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNAP23O00161 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNAP23O00161 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNAP23O00161 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNAP23O00161 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNAP23O00161 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNAP23O00161 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNAP23O00161 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNAP23O00161 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNAP23O00161 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNAP23O00161 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNAP23O00161 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNAP23O00161 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNAP23O00161 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SNAP23O00161 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SNAP23O00161 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNAP23O00161 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNAP23O00161 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNAP23O00161 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNAP23O00161 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNAP23O00161 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNAP23O00161 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SNAP23O00161 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SNAP23O00161 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SNAP23O00161 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SNAP23O00161 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SNAP23O00161 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SNAP23O00161 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SNAP23O00161 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SNAP23O00161 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SNAP23O00161 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNAP23O00161 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNAP23O00161 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNAP23O00161 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNAP23O00161 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNAP23O00161 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNAP23O00161 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNAP23O00161 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms