Protein–RNA interactions for Protein: F6WH68

RTEL1-TNFRSF6B, Regulator of telomere elongation helicase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.77
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms