Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLDN25C9JDP6 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
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