Protein–RNA interactions for Protein: B4DXG7

cDNA FLJ57652, highly similar to Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DXG7 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
B4DXG7 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
B4DXG7 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
B4DXG7 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
B4DXG7 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
B4DXG7 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
B4DXG7 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
B4DXG7 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
B4DXG7 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
B4DXG7 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
B4DXG7 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
B4DXG7 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
B4DXG7 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
B4DXG7 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
B4DXG7 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
B4DXG7 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
B4DXG7 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
B4DXG7 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
B4DXG7 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
B4DXG7 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
B4DXG7 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
B4DXG7 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
B4DXG7 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
B4DXG7 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
B4DXG7 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
B4DXG7 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
B4DXG7 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
B4DXG7 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
B4DXG7 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
B4DXG7 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
B4DXG7 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
B4DXG7 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
B4DXG7 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
B4DXG7 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
B4DXG7 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
B4DXG7 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
B4DXG7 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
B4DXG7 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
B4DXG7 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
B4DXG7 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
B4DXG7 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
B4DXG7 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
B4DXG7 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
B4DXG7 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
B4DXG7 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
B4DXG7 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
B4DXG7 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
B4DXG7 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
B4DXG7 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
B4DXG7 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
B4DXG7 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
B4DXG7 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
B4DXG7 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
B4DXG7 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
B4DXG7 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
B4DXG7 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
B4DXG7 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
B4DXG7 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
B4DXG7 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
B4DXG7 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
B4DXG7 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
B4DXG7 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
B4DXG7 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
B4DXG7 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
B4DXG7 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
B4DXG7 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
B4DXG7 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
B4DXG7 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
B4DXG7 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
B4DXG7 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
B4DXG7 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
B4DXG7 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
B4DXG7 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
B4DXG7 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
B4DXG7 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
B4DXG7 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
B4DXG7 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
B4DXG7 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
B4DXG7 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
B4DXG7 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
B4DXG7 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
B4DXG7 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
B4DXG7 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
B4DXG7 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
B4DXG7 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
B4DXG7 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
B4DXG7 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
B4DXG7 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
B4DXG7 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
B4DXG7 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
B4DXG7 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
B4DXG7 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
B4DXG7 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
B4DXG7 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
B4DXG7 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
B4DXG7 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
B4DXG7 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
B4DXG7 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
B4DXG7 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
B4DXG7 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms