Protein–RNA interactions for Protein: B0YJ81

HACD1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD1B0YJ81 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HACD1B0YJ81 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HACD1B0YJ81 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HACD1B0YJ81 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HACD1B0YJ81 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HACD1B0YJ81 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HACD1B0YJ81 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HACD1B0YJ81 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HACD1B0YJ81 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HACD1B0YJ81 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HACD1B0YJ81 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HACD1B0YJ81 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HACD1B0YJ81 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HACD1B0YJ81 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HACD1B0YJ81 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HACD1B0YJ81 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HACD1B0YJ81 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HACD1B0YJ81 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HACD1B0YJ81 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HACD1B0YJ81 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HACD1B0YJ81 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HACD1B0YJ81 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
HACD1B0YJ81 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HACD1B0YJ81 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HACD1B0YJ81 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HACD1B0YJ81 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
HACD1B0YJ81 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HACD1B0YJ81 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HACD1B0YJ81 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HACD1B0YJ81 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HACD1B0YJ81 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HACD1B0YJ81 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HACD1B0YJ81 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HACD1B0YJ81 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HACD1B0YJ81 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HACD1B0YJ81 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HACD1B0YJ81 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
HACD1B0YJ81 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HACD1B0YJ81 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HACD1B0YJ81 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
HACD1B0YJ81 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HACD1B0YJ81 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HACD1B0YJ81 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HACD1B0YJ81 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HACD1B0YJ81 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HACD1B0YJ81 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HACD1B0YJ81 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HACD1B0YJ81 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HACD1B0YJ81 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HACD1B0YJ81 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HACD1B0YJ81 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HACD1B0YJ81 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HACD1B0YJ81 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HACD1B0YJ81 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HACD1B0YJ81 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HACD1B0YJ81 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HACD1B0YJ81 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
HACD1B0YJ81 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HACD1B0YJ81 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HACD1B0YJ81 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HACD1B0YJ81 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HACD1B0YJ81 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HACD1B0YJ81 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HACD1B0YJ81 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HACD1B0YJ81 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HACD1B0YJ81 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HACD1B0YJ81 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HACD1B0YJ81 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HACD1B0YJ81 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HACD1B0YJ81 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HACD1B0YJ81 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HACD1B0YJ81 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HACD1B0YJ81 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HACD1B0YJ81 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HACD1B0YJ81 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HACD1B0YJ81 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HACD1B0YJ81 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HACD1B0YJ81 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HACD1B0YJ81 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HACD1B0YJ81 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HACD1B0YJ81 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HACD1B0YJ81 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HACD1B0YJ81 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HACD1B0YJ81 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HACD1B0YJ81 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HACD1B0YJ81 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HACD1B0YJ81 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HACD1B0YJ81 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HACD1B0YJ81 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HACD1B0YJ81 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HACD1B0YJ81 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HACD1B0YJ81 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HACD1B0YJ81 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HACD1B0YJ81 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HACD1B0YJ81 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HACD1B0YJ81 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HACD1B0YJ81 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HACD1B0YJ81 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HACD1B0YJ81 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HACD1B0YJ81 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms