Protein–RNA interactions for Protein: A6NHT5

HMX3, Homeobox protein HMX3, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX3A6NHT5 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMX3A6NHT5 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMX3A6NHT5 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMX3A6NHT5 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMX3A6NHT5 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMX3A6NHT5 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMX3A6NHT5 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMX3A6NHT5 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMX3A6NHT5 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMX3A6NHT5 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMX3A6NHT5 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMX3A6NHT5 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMX3A6NHT5 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMX3A6NHT5 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMX3A6NHT5 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMX3A6NHT5 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMX3A6NHT5 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMX3A6NHT5 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMX3A6NHT5 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMX3A6NHT5 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMX3A6NHT5 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMX3A6NHT5 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMX3A6NHT5 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HMX3A6NHT5 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMX3A6NHT5 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMX3A6NHT5 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMX3A6NHT5 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMX3A6NHT5 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HMX3A6NHT5 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMX3A6NHT5 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HMX3A6NHT5 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HMX3A6NHT5 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HMX3A6NHT5 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HMX3A6NHT5 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HMX3A6NHT5 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HMX3A6NHT5 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HMX3A6NHT5 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HMX3A6NHT5 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HMX3A6NHT5 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMX3A6NHT5 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMX3A6NHT5 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMX3A6NHT5 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMX3A6NHT5 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMX3A6NHT5 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMX3A6NHT5 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMX3A6NHT5 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMX3A6NHT5 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMX3A6NHT5 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HMX3A6NHT5 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMX3A6NHT5 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMX3A6NHT5 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMX3A6NHT5 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMX3A6NHT5 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMX3A6NHT5 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMX3A6NHT5 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMX3A6NHT5 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMX3A6NHT5 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMX3A6NHT5 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMX3A6NHT5 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMX3A6NHT5 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HMX3A6NHT5 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMX3A6NHT5 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMX3A6NHT5 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMX3A6NHT5 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMX3A6NHT5 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMX3A6NHT5 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMX3A6NHT5 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMX3A6NHT5 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMX3A6NHT5 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMX3A6NHT5 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMX3A6NHT5 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMX3A6NHT5 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMX3A6NHT5 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMX3A6NHT5 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMX3A6NHT5 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HMX3A6NHT5 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMX3A6NHT5 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMX3A6NHT5 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMX3A6NHT5 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMX3A6NHT5 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMX3A6NHT5 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMX3A6NHT5 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HMX3A6NHT5 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMX3A6NHT5 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMX3A6NHT5 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMX3A6NHT5 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMX3A6NHT5 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMX3A6NHT5 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMX3A6NHT5 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMX3A6NHT5 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMX3A6NHT5 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMX3A6NHT5 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMX3A6NHT5 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMX3A6NHT5 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMX3A6NHT5 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMX3A6NHT5 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMX3A6NHT5 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMX3A6NHT5 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMX3A6NHT5 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMX3A6NHT5 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms