Protein–RNA interactions for Protein: A6NFY4

NEMP2, Nuclear envelope integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEMP2A6NFY4 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEMP2A6NFY4 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
NEMP2A6NFY4 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEMP2A6NFY4 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEMP2A6NFY4 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEMP2A6NFY4 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEMP2A6NFY4 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEMP2A6NFY4 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEMP2A6NFY4 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
NEMP2A6NFY4 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEMP2A6NFY4 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEMP2A6NFY4 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEMP2A6NFY4 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEMP2A6NFY4 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEMP2A6NFY4 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEMP2A6NFY4 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEMP2A6NFY4 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
NEMP2A6NFY4 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEMP2A6NFY4 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEMP2A6NFY4 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEMP2A6NFY4 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEMP2A6NFY4 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
NEMP2A6NFY4 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEMP2A6NFY4 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEMP2A6NFY4 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEMP2A6NFY4 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
NEMP2A6NFY4 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEMP2A6NFY4 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEMP2A6NFY4 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEMP2A6NFY4 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEMP2A6NFY4 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEMP2A6NFY4 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEMP2A6NFY4 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEMP2A6NFY4 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEMP2A6NFY4 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEMP2A6NFY4 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEMP2A6NFY4 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEMP2A6NFY4 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEMP2A6NFY4 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEMP2A6NFY4 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEMP2A6NFY4 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NEMP2A6NFY4 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NEMP2A6NFY4 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NEMP2A6NFY4 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NEMP2A6NFY4 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NEMP2A6NFY4 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NEMP2A6NFY4 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NEMP2A6NFY4 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NEMP2A6NFY4 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NEMP2A6NFY4 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NEMP2A6NFY4 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NEMP2A6NFY4 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NEMP2A6NFY4 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
NEMP2A6NFY4 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NEMP2A6NFY4 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NEMP2A6NFY4 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NEMP2A6NFY4 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
NEMP2A6NFY4 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NEMP2A6NFY4 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NEMP2A6NFY4 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NEMP2A6NFY4 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NEMP2A6NFY4 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms