Protein–RNA interactions for Protein: A4FU01

MTMR11, Myotubularin-related protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR11A4FU01 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
MTMR11A4FU01 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MTMR11A4FU01 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MTMR11A4FU01 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MTMR11A4FU01 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MTMR11A4FU01 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MTMR11A4FU01 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MTMR11A4FU01 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MTMR11A4FU01 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MTMR11A4FU01 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MTMR11A4FU01 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MTMR11A4FU01 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MTMR11A4FU01 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MTMR11A4FU01 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MTMR11A4FU01 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MTMR11A4FU01 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MTMR11A4FU01 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MTMR11A4FU01 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
MTMR11A4FU01 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
MTMR11A4FU01 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MTMR11A4FU01 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
MTMR11A4FU01 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
MTMR11A4FU01 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
MTMR11A4FU01 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
MTMR11A4FU01 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MTMR11A4FU01 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
MTMR11A4FU01 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MTMR11A4FU01 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MTMR11A4FU01 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
MTMR11A4FU01 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MTMR11A4FU01 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
MTMR11A4FU01 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MTMR11A4FU01 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MTMR11A4FU01 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
MTMR11A4FU01 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MTMR11A4FU01 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MTMR11A4FU01 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MTMR11A4FU01 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MTMR11A4FU01 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
MTMR11A4FU01 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MTMR11A4FU01 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MTMR11A4FU01 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MTMR11A4FU01 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MTMR11A4FU01 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MTMR11A4FU01 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MTMR11A4FU01 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MTMR11A4FU01 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MTMR11A4FU01 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MTMR11A4FU01 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MTMR11A4FU01 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MTMR11A4FU01 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MTMR11A4FU01 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MTMR11A4FU01 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MTMR11A4FU01 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MTMR11A4FU01 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MTMR11A4FU01 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MTMR11A4FU01 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MTMR11A4FU01 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MTMR11A4FU01 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MTMR11A4FU01 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MTMR11A4FU01 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MTMR11A4FU01 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MTMR11A4FU01 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MTMR11A4FU01 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MTMR11A4FU01 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MTMR11A4FU01 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MTMR11A4FU01 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MTMR11A4FU01 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MTMR11A4FU01 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MTMR11A4FU01 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MTMR11A4FU01 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MTMR11A4FU01 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MTMR11A4FU01 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MTMR11A4FU01 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
MTMR11A4FU01 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MTMR11A4FU01 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MTMR11A4FU01 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MTMR11A4FU01 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MTMR11A4FU01 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MTMR11A4FU01 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MTMR11A4FU01 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MTMR11A4FU01 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MTMR11A4FU01 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MTMR11A4FU01 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MTMR11A4FU01 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MTMR11A4FU01 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MTMR11A4FU01 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MTMR11A4FU01 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MTMR11A4FU01 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MTMR11A4FU01 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MTMR11A4FU01 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MTMR11A4FU01 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MTMR11A4FU01 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MTMR11A4FU01 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MTMR11A4FU01 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MTMR11A4FU01 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MTMR11A4FU01 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MTMR11A4FU01 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MTMR11A4FU01 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MTMR11A4FU01 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms