Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRAMEF22A3QJZ6 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRAMEF22A3QJZ6 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRAMEF22A3QJZ6 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRAMEF22A3QJZ6 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRAMEF22A3QJZ6 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRAMEF22A3QJZ6 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PRAMEF22A3QJZ6 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PRAMEF22A3QJZ6 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PRAMEF22A3QJZ6 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PRAMEF22A3QJZ6 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PRAMEF22A3QJZ6 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PRAMEF22A3QJZ6 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PRAMEF22A3QJZ6 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRAMEF22A3QJZ6 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRAMEF22A3QJZ6 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRAMEF22A3QJZ6 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRAMEF22A3QJZ6 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRAMEF22A3QJZ6 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRAMEF22A3QJZ6 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRAMEF22A3QJZ6 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRAMEF22A3QJZ6 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRAMEF22A3QJZ6 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PRAMEF22A3QJZ6 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRAMEF22A3QJZ6 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PRAMEF22A3QJZ6 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRAMEF22A3QJZ6 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRAMEF22A3QJZ6 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PRAMEF22A3QJZ6 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PRAMEF22A3QJZ6 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PRAMEF22A3QJZ6 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRAMEF22A3QJZ6 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRAMEF22A3QJZ6 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRAMEF22A3QJZ6 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PRAMEF22A3QJZ6 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRAMEF22A3QJZ6 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRAMEF22A3QJZ6 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRAMEF22A3QJZ6 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRAMEF22A3QJZ6 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRAMEF22A3QJZ6 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRAMEF22A3QJZ6 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRAMEF22A3QJZ6 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRAMEF22A3QJZ6 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRAMEF22A3QJZ6 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRAMEF22A3QJZ6 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRAMEF22A3QJZ6 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRAMEF22A3QJZ6 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRAMEF22A3QJZ6 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRAMEF22A3QJZ6 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRAMEF22A3QJZ6 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRAMEF22A3QJZ6 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRAMEF22A3QJZ6 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRAMEF22A3QJZ6 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRAMEF22A3QJZ6 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRAMEF22A3QJZ6 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRAMEF22A3QJZ6 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRAMEF22A3QJZ6 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRAMEF22A3QJZ6 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PRAMEF22A3QJZ6 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRAMEF22A3QJZ6 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRAMEF22A3QJZ6 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRAMEF22A3QJZ6 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PRAMEF22A3QJZ6 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PRAMEF22A3QJZ6 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PRAMEF22A3QJZ6 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRAMEF22A3QJZ6 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRAMEF22A3QJZ6 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRAMEF22A3QJZ6 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRAMEF22A3QJZ6 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRAMEF22A3QJZ6 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRAMEF22A3QJZ6 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRAMEF22A3QJZ6 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRAMEF22A3QJZ6 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRAMEF22A3QJZ6 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRAMEF22A3QJZ6 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRAMEF22A3QJZ6 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRAMEF22A3QJZ6 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRAMEF22A3QJZ6 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRAMEF22A3QJZ6 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRAMEF22A3QJZ6 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRAMEF22A3QJZ6 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRAMEF22A3QJZ6 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRAMEF22A3QJZ6 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PRAMEF22A3QJZ6 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRAMEF22A3QJZ6 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRAMEF22A3QJZ6 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRAMEF22A3QJZ6 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRAMEF22A3QJZ6 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRAMEF22A3QJZ6 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRAMEF22A3QJZ6 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRAMEF22A3QJZ6 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRAMEF22A3QJZ6 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRAMEF22A3QJZ6 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRAMEF22A3QJZ6 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRAMEF22A3QJZ6 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRAMEF22A3QJZ6 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms