Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K2

SIK3, Serine/threonine-protein kinase SIK3, humanhuman

Predictions only

Length 1,263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIK3Q9Y2K2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SIK3Q9Y2K2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SIK3Q9Y2K2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SIK3Q9Y2K2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SIK3Q9Y2K2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
SIK3Q9Y2K2 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SIK3Q9Y2K2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
SIK3Q9Y2K2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
SIK3Q9Y2K2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SIK3Q9Y2K2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SIK3Q9Y2K2 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SIK3Q9Y2K2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SIK3Q9Y2K2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SIK3Q9Y2K2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SIK3Q9Y2K2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SIK3Q9Y2K2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SIK3Q9Y2K2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SIK3Q9Y2K2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SIK3Q9Y2K2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SIK3Q9Y2K2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SIK3Q9Y2K2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SIK3Q9Y2K2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SIK3Q9Y2K2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SIK3Q9Y2K2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SIK3Q9Y2K2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SIK3Q9Y2K2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SIK3Q9Y2K2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SIK3Q9Y2K2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SIK3Q9Y2K2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SIK3Q9Y2K2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SIK3Q9Y2K2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SIK3Q9Y2K2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SIK3Q9Y2K2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
SIK3Q9Y2K2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
SIK3Q9Y2K2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SIK3Q9Y2K2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SIK3Q9Y2K2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SIK3Q9Y2K2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SIK3Q9Y2K2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SIK3Q9Y2K2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SIK3Q9Y2K2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
SIK3Q9Y2K2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SIK3Q9Y2K2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SIK3Q9Y2K2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SIK3Q9Y2K2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SIK3Q9Y2K2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SIK3Q9Y2K2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SIK3Q9Y2K2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SIK3Q9Y2K2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SIK3Q9Y2K2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SIK3Q9Y2K2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SIK3Q9Y2K2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SIK3Q9Y2K2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SIK3Q9Y2K2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SIK3Q9Y2K2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SIK3Q9Y2K2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SIK3Q9Y2K2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SIK3Q9Y2K2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SIK3Q9Y2K2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SIK3Q9Y2K2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SIK3Q9Y2K2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SIK3Q9Y2K2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
SIK3Q9Y2K2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SIK3Q9Y2K2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SIK3Q9Y2K2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
SIK3Q9Y2K2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SIK3Q9Y2K2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SIK3Q9Y2K2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SIK3Q9Y2K2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SIK3Q9Y2K2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SIK3Q9Y2K2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SIK3Q9Y2K2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SIK3Q9Y2K2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SIK3Q9Y2K2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SIK3Q9Y2K2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SIK3Q9Y2K2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SIK3Q9Y2K2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SIK3Q9Y2K2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SIK3Q9Y2K2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SIK3Q9Y2K2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SIK3Q9Y2K2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SIK3Q9Y2K2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SIK3Q9Y2K2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SIK3Q9Y2K2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SIK3Q9Y2K2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SIK3Q9Y2K2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SIK3Q9Y2K2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SIK3Q9Y2K2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SIK3Q9Y2K2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SIK3Q9Y2K2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SIK3Q9Y2K2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SIK3Q9Y2K2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SIK3Q9Y2K2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
SIK3Q9Y2K2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SIK3Q9Y2K2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
SIK3Q9Y2K2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
SIK3Q9Y2K2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SIK3Q9Y2K2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SIK3Q9Y2K2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SIK3Q9Y2K2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms