Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN81

L1RE1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1RE1Q9UN81 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
L1RE1Q9UN81 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
L1RE1Q9UN81 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
L1RE1Q9UN81 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
L1RE1Q9UN81 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
L1RE1Q9UN81 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
L1RE1Q9UN81 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
L1RE1Q9UN81 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
L1RE1Q9UN81 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
L1RE1Q9UN81 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
L1RE1Q9UN81 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
L1RE1Q9UN81 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
L1RE1Q9UN81 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
L1RE1Q9UN81 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
L1RE1Q9UN81 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
L1RE1Q9UN81 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
L1RE1Q9UN81 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
L1RE1Q9UN81 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
L1RE1Q9UN81 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
L1RE1Q9UN81 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
L1RE1Q9UN81 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
L1RE1Q9UN81 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
L1RE1Q9UN81 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
L1RE1Q9UN81 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
L1RE1Q9UN81 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
L1RE1Q9UN81 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
L1RE1Q9UN81 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
L1RE1Q9UN81 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
L1RE1Q9UN81 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
L1RE1Q9UN81 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
L1RE1Q9UN81 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
L1RE1Q9UN81 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
L1RE1Q9UN81 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
L1RE1Q9UN81 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
L1RE1Q9UN81 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
L1RE1Q9UN81 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
L1RE1Q9UN81 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
L1RE1Q9UN81 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
L1RE1Q9UN81 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
L1RE1Q9UN81 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
L1RE1Q9UN81 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
L1RE1Q9UN81 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
L1RE1Q9UN81 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
L1RE1Q9UN81 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
L1RE1Q9UN81 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
L1RE1Q9UN81 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
L1RE1Q9UN81 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
L1RE1Q9UN81 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
L1RE1Q9UN81 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
L1RE1Q9UN81 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
L1RE1Q9UN81 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
L1RE1Q9UN81 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
L1RE1Q9UN81 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
L1RE1Q9UN81 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
L1RE1Q9UN81 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
L1RE1Q9UN81 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
L1RE1Q9UN81 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
L1RE1Q9UN81 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
L1RE1Q9UN81 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
L1RE1Q9UN81 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
L1RE1Q9UN81 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
L1RE1Q9UN81 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
L1RE1Q9UN81 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
L1RE1Q9UN81 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
L1RE1Q9UN81 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
L1RE1Q9UN81 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
L1RE1Q9UN81 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
L1RE1Q9UN81 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
L1RE1Q9UN81 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
L1RE1Q9UN81 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
L1RE1Q9UN81 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
L1RE1Q9UN81 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
L1RE1Q9UN81 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
L1RE1Q9UN81 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
L1RE1Q9UN81 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
L1RE1Q9UN81 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
L1RE1Q9UN81 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
L1RE1Q9UN81 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
L1RE1Q9UN81 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
L1RE1Q9UN81 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
L1RE1Q9UN81 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
L1RE1Q9UN81 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
L1RE1Q9UN81 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
L1RE1Q9UN81 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
L1RE1Q9UN81 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
L1RE1Q9UN81 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
L1RE1Q9UN81 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
L1RE1Q9UN81 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
L1RE1Q9UN81 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
L1RE1Q9UN81 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
L1RE1Q9UN81 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
L1RE1Q9UN81 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
L1RE1Q9UN81 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
L1RE1Q9UN81 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
L1RE1Q9UN81 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
L1RE1Q9UN81 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
L1RE1Q9UN81 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
L1RE1Q9UN81 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
L1RE1Q9UN81 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
L1RE1Q9UN81 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms