Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN72

PCDHA7, Protocadherin alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHA7Q9UN72 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PCDHA7Q9UN72 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PCDHA7Q9UN72 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PCDHA7Q9UN72 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PCDHA7Q9UN72 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PCDHA7Q9UN72 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PCDHA7Q9UN72 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PCDHA7Q9UN72 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PCDHA7Q9UN72 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PCDHA7Q9UN72 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PCDHA7Q9UN72 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
PCDHA7Q9UN72 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PCDHA7Q9UN72 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PCDHA7Q9UN72 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
PCDHA7Q9UN72 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PCDHA7Q9UN72 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PCDHA7Q9UN72 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PCDHA7Q9UN72 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PCDHA7Q9UN72 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PCDHA7Q9UN72 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PCDHA7Q9UN72 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
PCDHA7Q9UN72 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PCDHA7Q9UN72 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PCDHA7Q9UN72 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
PCDHA7Q9UN72 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PCDHA7Q9UN72 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PCDHA7Q9UN72 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PCDHA7Q9UN72 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PCDHA7Q9UN72 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
PCDHA7Q9UN72 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PCDHA7Q9UN72 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PCDHA7Q9UN72 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PCDHA7Q9UN72 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PCDHA7Q9UN72 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
PCDHA7Q9UN72 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
PCDHA7Q9UN72 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PCDHA7Q9UN72 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PCDHA7Q9UN72 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PCDHA7Q9UN72 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PCDHA7Q9UN72 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PCDHA7Q9UN72 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PCDHA7Q9UN72 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PCDHA7Q9UN72 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PCDHA7Q9UN72 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PCDHA7Q9UN72 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PCDHA7Q9UN72 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PCDHA7Q9UN72 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PCDHA7Q9UN72 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PCDHA7Q9UN72 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PCDHA7Q9UN72 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PCDHA7Q9UN72 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PCDHA7Q9UN72 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PCDHA7Q9UN72 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PCDHA7Q9UN72 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PCDHA7Q9UN72 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PCDHA7Q9UN72 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PCDHA7Q9UN72 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PCDHA7Q9UN72 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PCDHA7Q9UN72 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PCDHA7Q9UN72 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PCDHA7Q9UN72 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PCDHA7Q9UN72 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PCDHA7Q9UN72 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PCDHA7Q9UN72 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PCDHA7Q9UN72 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PCDHA7Q9UN72 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
PCDHA7Q9UN72 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PCDHA7Q9UN72 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PCDHA7Q9UN72 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PCDHA7Q9UN72 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PCDHA7Q9UN72 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PCDHA7Q9UN72 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PCDHA7Q9UN72 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PCDHA7Q9UN72 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PCDHA7Q9UN72 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PCDHA7Q9UN72 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PCDHA7Q9UN72 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PCDHA7Q9UN72 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
PCDHA7Q9UN72 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PCDHA7Q9UN72 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PCDHA7Q9UN72 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PCDHA7Q9UN72 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PCDHA7Q9UN72 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PCDHA7Q9UN72 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PCDHA7Q9UN72 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PCDHA7Q9UN72 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PCDHA7Q9UN72 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PCDHA7Q9UN72 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PCDHA7Q9UN72 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PCDHA7Q9UN72 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PCDHA7Q9UN72 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PCDHA7Q9UN72 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PCDHA7Q9UN72 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
PCDHA7Q9UN72 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PCDHA7Q9UN72 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PCDHA7Q9UN72 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
PCDHA7Q9UN72 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
PCDHA7Q9UN72 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
PCDHA7Q9UN72 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PCDHA7Q9UN72 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.3 ms