Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJW0

DCTN4, Dynactin subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN4Q9UJW0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DCTN4Q9UJW0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DCTN4Q9UJW0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DCTN4Q9UJW0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DCTN4Q9UJW0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DCTN4Q9UJW0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DCTN4Q9UJW0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DCTN4Q9UJW0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DCTN4Q9UJW0 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DCTN4Q9UJW0 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DCTN4Q9UJW0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DCTN4Q9UJW0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DCTN4Q9UJW0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DCTN4Q9UJW0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DCTN4Q9UJW0 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DCTN4Q9UJW0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DCTN4Q9UJW0 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DCTN4Q9UJW0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DCTN4Q9UJW0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DCTN4Q9UJW0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DCTN4Q9UJW0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DCTN4Q9UJW0 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DCTN4Q9UJW0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DCTN4Q9UJW0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DCTN4Q9UJW0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DCTN4Q9UJW0 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DCTN4Q9UJW0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DCTN4Q9UJW0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DCTN4Q9UJW0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DCTN4Q9UJW0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DCTN4Q9UJW0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DCTN4Q9UJW0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
DCTN4Q9UJW0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DCTN4Q9UJW0 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DCTN4Q9UJW0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DCTN4Q9UJW0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DCTN4Q9UJW0 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DCTN4Q9UJW0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DCTN4Q9UJW0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DCTN4Q9UJW0 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DCTN4Q9UJW0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DCTN4Q9UJW0 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DCTN4Q9UJW0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DCTN4Q9UJW0 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DCTN4Q9UJW0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DCTN4Q9UJW0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DCTN4Q9UJW0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DCTN4Q9UJW0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DCTN4Q9UJW0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DCTN4Q9UJW0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DCTN4Q9UJW0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
DCTN4Q9UJW0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DCTN4Q9UJW0 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DCTN4Q9UJW0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DCTN4Q9UJW0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DCTN4Q9UJW0 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DCTN4Q9UJW0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DCTN4Q9UJW0 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DCTN4Q9UJW0 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DCTN4Q9UJW0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DCTN4Q9UJW0 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DCTN4Q9UJW0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DCTN4Q9UJW0 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DCTN4Q9UJW0 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DCTN4Q9UJW0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DCTN4Q9UJW0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DCTN4Q9UJW0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DCTN4Q9UJW0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DCTN4Q9UJW0 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DCTN4Q9UJW0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DCTN4Q9UJW0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DCTN4Q9UJW0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
DCTN4Q9UJW0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DCTN4Q9UJW0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DCTN4Q9UJW0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24■■□□□ 1.43
DCTN4Q9UJW0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24■■□□□ 1.43
DCTN4Q9UJW0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DCTN4Q9UJW0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24■■□□□ 1.43
DCTN4Q9UJW0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24■■□□□ 1.43
DCTN4Q9UJW0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DCTN4Q9UJW0 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
DCTN4Q9UJW0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DCTN4Q9UJW0 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DCTN4Q9UJW0 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DCTN4Q9UJW0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DCTN4Q9UJW0 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DCTN4Q9UJW0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
DCTN4Q9UJW0 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DCTN4Q9UJW0 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DCTN4Q9UJW0 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
DCTN4Q9UJW0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DCTN4Q9UJW0 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
DCTN4Q9UJW0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DCTN4Q9UJW0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DCTN4Q9UJW0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DCTN4Q9UJW0 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DCTN4Q9UJW0 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DCTN4Q9UJW0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DCTN4Q9UJW0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DCTN4Q9UJW0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms