Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBR5

CKLF, Chemokine-like factor, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKLFQ9UBR5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CKLFQ9UBR5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CKLFQ9UBR5 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CKLFQ9UBR5 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CKLFQ9UBR5 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CKLFQ9UBR5 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CKLFQ9UBR5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CKLFQ9UBR5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CKLFQ9UBR5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CKLFQ9UBR5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CKLFQ9UBR5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CKLFQ9UBR5 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CKLFQ9UBR5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CKLFQ9UBR5 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CKLFQ9UBR5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CKLFQ9UBR5 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CKLFQ9UBR5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CKLFQ9UBR5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CKLFQ9UBR5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CKLFQ9UBR5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CKLFQ9UBR5 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CKLFQ9UBR5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CKLFQ9UBR5 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CKLFQ9UBR5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CKLFQ9UBR5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CKLFQ9UBR5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CKLFQ9UBR5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CKLFQ9UBR5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CKLFQ9UBR5 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CKLFQ9UBR5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CKLFQ9UBR5 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CKLFQ9UBR5 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CKLFQ9UBR5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CKLFQ9UBR5 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CKLFQ9UBR5 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CKLFQ9UBR5 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CKLFQ9UBR5 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CKLFQ9UBR5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CKLFQ9UBR5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CKLFQ9UBR5 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CKLFQ9UBR5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CKLFQ9UBR5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CKLFQ9UBR5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CKLFQ9UBR5 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
CKLFQ9UBR5 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CKLFQ9UBR5 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CKLFQ9UBR5 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CKLFQ9UBR5 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CKLFQ9UBR5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CKLFQ9UBR5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CKLFQ9UBR5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CKLFQ9UBR5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CKLFQ9UBR5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CKLFQ9UBR5 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CKLFQ9UBR5 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CKLFQ9UBR5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CKLFQ9UBR5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CKLFQ9UBR5 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CKLFQ9UBR5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CKLFQ9UBR5 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CKLFQ9UBR5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CKLFQ9UBR5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CKLFQ9UBR5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CKLFQ9UBR5 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CKLFQ9UBR5 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CKLFQ9UBR5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CKLFQ9UBR5 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CKLFQ9UBR5 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CKLFQ9UBR5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CKLFQ9UBR5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CKLFQ9UBR5 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CKLFQ9UBR5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CKLFQ9UBR5 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CKLFQ9UBR5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CKLFQ9UBR5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CKLFQ9UBR5 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CKLFQ9UBR5 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CKLFQ9UBR5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
CKLFQ9UBR5 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CKLFQ9UBR5 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CKLFQ9UBR5 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CKLFQ9UBR5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CKLFQ9UBR5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CKLFQ9UBR5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CKLFQ9UBR5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CKLFQ9UBR5 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CKLFQ9UBR5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CKLFQ9UBR5 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CKLFQ9UBR5 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CKLFQ9UBR5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CKLFQ9UBR5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CKLFQ9UBR5 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CKLFQ9UBR5 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CKLFQ9UBR5 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CKLFQ9UBR5 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CKLFQ9UBR5 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CKLFQ9UBR5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CKLFQ9UBR5 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CKLFQ9UBR5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CKLFQ9UBR5 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms