Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J3

KLHL9, Kelch-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL9Q9P2J3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL9Q9P2J3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL9Q9P2J3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL9Q9P2J3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL9Q9P2J3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL9Q9P2J3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL9Q9P2J3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL9Q9P2J3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL9Q9P2J3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL9Q9P2J3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL9Q9P2J3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL9Q9P2J3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL9Q9P2J3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL9Q9P2J3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL9Q9P2J3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL9Q9P2J3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL9Q9P2J3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL9Q9P2J3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL9Q9P2J3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL9Q9P2J3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL9Q9P2J3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL9Q9P2J3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL9Q9P2J3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL9Q9P2J3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL9Q9P2J3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL9Q9P2J3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL9Q9P2J3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL9Q9P2J3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL9Q9P2J3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL9Q9P2J3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL9Q9P2J3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL9Q9P2J3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL9Q9P2J3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL9Q9P2J3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL9Q9P2J3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL9Q9P2J3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL9Q9P2J3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL9Q9P2J3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL9Q9P2J3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL9Q9P2J3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL9Q9P2J3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL9Q9P2J3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHL9Q9P2J3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHL9Q9P2J3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHL9Q9P2J3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL9Q9P2J3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL9Q9P2J3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL9Q9P2J3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL9Q9P2J3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL9Q9P2J3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL9Q9P2J3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL9Q9P2J3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL9Q9P2J3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL9Q9P2J3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL9Q9P2J3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL9Q9P2J3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL9Q9P2J3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL9Q9P2J3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHL9Q9P2J3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHL9Q9P2J3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHL9Q9P2J3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHL9Q9P2J3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHL9Q9P2J3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHL9Q9P2J3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHL9Q9P2J3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHL9Q9P2J3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHL9Q9P2J3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHL9Q9P2J3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHL9Q9P2J3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHL9Q9P2J3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLHL9Q9P2J3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLHL9Q9P2J3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLHL9Q9P2J3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLHL9Q9P2J3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLHL9Q9P2J3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLHL9Q9P2J3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLHL9Q9P2J3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
KLHL9Q9P2J3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
KLHL9Q9P2J3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHL9Q9P2J3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHL9Q9P2J3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHL9Q9P2J3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHL9Q9P2J3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHL9Q9P2J3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHL9Q9P2J3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHL9Q9P2J3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHL9Q9P2J3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHL9Q9P2J3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHL9Q9P2J3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHL9Q9P2J3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHL9Q9P2J3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHL9Q9P2J3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHL9Q9P2J3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHL9Q9P2J3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHL9Q9P2J3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHL9Q9P2J3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHL9Q9P2J3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHL9Q9P2J3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHL9Q9P2J3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHL9Q9P2J3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms